学位論文
博士論文
2014.09
| Dian Novitasari | Development of an artificial fluorescent protein derived from Photoactive Yellow Protein (Photoactive Yellow Proteinを用いた人工蛍光蛋白質の研究) |
2011.03
| 芝 るみ | 網羅的アラニン挿入変異解析を用いたジヒドロ葉酸還元酵素の構造形成及び機能発現機構の研究 |
2010.09
| 加藤 真悟 | Staphylococcal nucleaseの折りたたみ過程における非局所的相互作用の役割に関する研究 |
2009.12
| 森下 友和 | イェロープロテインの疎水性コアを形成する芳香族アミノ酸残基の役割 |
2009.06
| 鬼塚 正義 | Mechanism of induced folding of staphylococcal nuclease mutants （スタフィロコッカルヌクレアーゼ変異体の誘導折り畳み機構） |
2009.03
| 山口 繁生 | Structural Analysis of Photoactive Yellow Protein by Neutron Crystallography （Photoactive Yellow Proteinの中性子結晶構造解析） |
2007.03
| 白井 久美子 | Simplification of the Amino-Acid Sequence of Photoactive Yellow Protein with a Set of Simple rules （イエロープロテインのアミノ酸配列単純化に関する研究） |
| 徳久 淳師 | Molecular dynamics simulation studies on the analysis of neutron incoherent scattering due to protein dynamics （分子動力学シミュレーションを用いたタンパク質ダイナミクスの中性子非干渉性散乱の解析に関する研究） |
2006.06
| 對比地 久義 | Cloning and Characterization of nif Structural and Regulatory Genes in the Purple Sulfur Bacterium, Halorhodospira halophila （紅色硫黄細菌 Halorhodospira halophila 由来ニトロゲナーゼ遺伝子のクローニングとその性質） |
2006.03
| 針貝 美樹 | イエロープロテインの光構造変化機構の解析 NAIST最優秀論文賞受賞 |
2004.03
| 中川 洋 | Neutron Incoherent Scattering Studies on Protein Dynamics （タンパク質動力学の非干渉性中性子散乱による研究） NAIST最優秀論文賞受賞 |
2003.03
| 清水 伸隆 | Structural properties of photointermediate of photoactive yellow protein-Mechanism of target recognition- （イエロープロテインの光反応中間体の構造的特徴ー標的認識機構ー） |
| 平野 聡 | Folding mechanism of Staphylococcal nuclease: the role of C-terminal region （スタフィロコッカル・ヌクレアーゼの折り畳み機構：C末領域の役割） |
修士論文
2014.03
| 太田 恵美 | フェルスター共鳴エネルギー移動を用いたStaphylococcal nucleaseの変性構造に関する研究 |
| 新川 舞 | 人工酵素に移植した機能エレメントの役割 |
| 野路 将義 | PYPM中間体におけるアルギニン52のプロトン化状態 |
| 松本 昇紘 | Tryptophan三重項寿命測定によるStaphylococcal nucleaseの主鎖の運動性評価 |
| 松本 寛史 | Rhodobacter capsulatus由来 Photoactive Yellow ProteinのX線結晶構造解析 |
| 松本 芳晃 | Photoactive Yellow Proteinの光誘起構造変化を制御する領域の解明 |
| 峯村 俊行 | Staphylococcal nucleaseの変性構造における局所的相互作用と非局所的相互作用の評価 |
| 森元 俊雄 | Green Fluorescent Proteinの機能エレメントの抽出 |
2013.03
| 上月 尚治 | ヒトカルシトニンアミロイド線維形成の阻害機構の解明 |
| 左近司 充洋 | Photoactive yellow proteinにおける構造エレメントの抽出 |
| 島田 麻由 | キメラタンパク質を用いたRhodobacter capsulatus由来Photoactive yellow proteinの相互作用部位の解明 |
| 鳴海 正寿 | 桂皮酸を導入したPhotoactive yellow proteinの発色団由来水素結合の欠損効果 |
| 吉田 桂人 | PYP-Phytochrome Related Proteinの光誘起構造変化 |
| 米澤 健人 | Photoactive yellow proteinにおけるアルギニン52のプロトン化状態 |
2012.03
| 上柳 翔 | 相同タンパク質間における構造エレメントの保存性 |
| 岡田 俊洋 | トリプトファン三重項測定による黄色ブドウ球菌核酸分解酵素の変性構造に関する研究 |
| 小谷 亮太 | N端領域キメラを用いたPhotoactive Yellow Proteinの光反応の研究 |
| 坂井 絵厘 | エレメント移植によるタンパク質機能の改変 |
| 瀬戸口 信弥 | Photoactive Yellow Proteinを用いたタンパク質光制御系の開発のための基礎研究 |
| 西口 佑介 | Photoactive Yellow Proteinの短距離水素結合と低障壁水素結合の関係 |
2011.03
| 岸 裕亮 | 部位特異的に蛍光標識された黄色ブドウ球菌由来核酸分解酵素の合成と物性評価 |
| 君島 寛倫 | SNaseの構造形成に関わる非局所相互作用をもたらすC末端領域の探索 |
| 成瀬 妹子 | ショウジョウバエ由来全長GGAの溶液構造解析 |
| 林 美希 | Rhodobacter capsulatus由来Photoactive Yellow Proteinと相互作用タンパク質の溶液構造解析 |
| 三浦 純子 | 光センサー型ヒスチジンキナーゼPprにおけるドメイン間の相互作用による光反応調節 |
| 安 昌濬 | Staphylococcal nuclease Ωループ変異体の結晶構造解析 |
2010.03
| 小川 洋子 | 類似構造蛋白質間での構造エレメントの比較 |
| 久保 晴政 | Rc-PYPと相互作用タンパク質を用いた酵素活性の光制御系の作製 |
| 小賀坂 彰浩 | エレメント置換による蛋白質の機能獲得の試み |
| 齊藤 謙介 | Azobenzeneを用いた構造エレメントのモジュレーション |
| 濱口 祐也 | Rhodobacter capsulatus由来Photoactive Yellow Proteinの低温分光法による吸収スペクトルの評価 |
| 松本 啓佑 | キメラを用いたPhotoactive Yellow Proteinの研究 |
| 吉岡 紘志 | SNaseアラニン挿入変異体の結晶構造解析による構造評価 |
2009.03
| 太田 成人 | Rc-PYPの光反応におけるN末端部位の役割 |
| 米田 知可子 | Human p100 SNase 様ドメインの構造形成に関する研究 |
| 田所 成文 | 黄色ブドウ球菌核酸分解酵素におけるループの揺らぎと機能の関係 |
| 中垣 礼寧 | Staphylococcal nucleaseの折り畳みにおけるロイシン108の役割 |
| 中西 勇人 | 光受容蛋白質AppAの分子内相互作用機構 |
2008.03
| 小山 知則 | 紅色光合成細菌Rhodospirillum centenum由来PYP様ドメインの光反応解析 |
| 浴口 真幸 | Rhodobacter capsulatus由来Photoactive Yellow Proteinの光反応 |
| 澤田 宏起 | アラニン挿入によるStaphylococcal nucleaseの折り畳み初期過程に必要な相互作用を担う領域の探索 |
| 芝 るみ | 網羅的アラニン挿入変異解析法によるジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現及び構造形成領域の抽出 |
| 政 さやか | ジヒドロ葉酸還元酵素（DHFR）における構造形成能と機能発現の関連性 |
| 永田 大介 | Ala/ValスキャンによるPhotoactive Yellow Proteinの全側鎖情報抽出 |
2007.03
| 阿野 誠士 | 青色光受容蛋白質AppAと光合成遺伝子発現抑制蛋白質PpsRの相互作用領域の探索 |
| 池田 洋平 | 自己会合によるアレスチンの活性調節機構の解明 |
| 梅山 美香 | 系統的アラニン挿入変異解析によるジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現・構造形成に関わる領域の探索 |
| 北村 大典 | 単純化されたアミノ酸配列を持つStaphylococcal nucleaseの創製 |
| 小寺 崇雄 | 増感型バクテリオロドプシン調整の試み |
| 平子 和美 | 小胞輸送に関わる蛋白質GGAの蛋白質間相互作用のX線小角散乱法による構造学的解析 最優秀学生賞受賞 |
2006.03
| 加藤 真悟 | Staphylococcal nuclease の折りたたみ過程における非局所的相互作用の重要性 |
| 坂本 亜沙美 | Photoactive Yellow Protein のアミロイド線維形成 |
| 笹山 裕晃 | Photoactive Yellow Protein の光反応におけるループ領域の役割 |
| 中田 浩司 | 単純化されたアミノ酸配列を持つPhotoactive Yellow Protein の機能回復 |
| 馬場 隆 | Staphylococcal nuclease の折り畳み反応におけるグリセロール添加の効果 |
| 山口 繁生 | 中性子結晶構造解析に用いる巨大Photoactive Yellow Protein 結晶の調製 |
2005.03
| 中山 真里 | アラニン挿入がStaphylococcal Nucleaseの構造形成および機能発現に与える影響 |
| 林 道弘 | 紅色光合成細菌Rhodospirillum centenum由来フィトクロム様蛋白質Ppr及びPYPの光反応 |
| 福角 勇人 | 光合成遺伝子発現制御タンパク質（PpsR）の相互作用部位の探索 |
| 藤本 知志 | 光応答性融合蛋白質の設計及び創成 |
| 村嵜 康浩 | 小胞輸送に関わるタンパク質GGAの構成ドメインの溶液構造 |
| 守田 真 | 青色光受容タンパク質AppAの分光学的特性及び標的タンパク質PpsRとの相互作用 |
2004.03
| 鬼塚 正義 | Staphylococcal nuclease における基質誘導折り畳み反応のメカニズム |
| 城 啓太郎 | Rhodobacter sphaeroudes由来HupTの会合体形成におけるPASドメインの役割 |
| 徳久 淳師 | 分子シュミレーションを用いた中性子弾性散乱データにおける蛋白質動力学の非調和性評価 |
| 南村 直樹 | アラニン挿入変異体を用いた構造形成・機能発現機構の解析～Staphylococcal nuclease 98番残基以降のα-へリックス、Ωループ領域について～ |
| 森下 友和 | イエロープロテインにおけるフェニルアラニン９６の役割 |
2003.03
| 久保田 進 | Staphylococcal nuclease の折りたたみによる疎水性相互作用の重要性 |
| 黒田 崇之 | Photoactive Yellow Protein におけるプロトンドナー改変の光反応への影響 |
| 白井 久美子 | 単純化されたアミノ酸配列を持つイエロープロテインの創製 |
| 龍見 さなえ | Photoactive Yellow Protein におけるグリシン残基の役割 |
| 平岡 聡 | Staphylococcal nuclease の構造・機能に関するΩループの役割 |
| 間野 絵梨子 | Photoactive Yellow Protein の結晶中と溶液中での光化学反応の比較 |
| 安田 玲里 | イエロープロテインの構造・光反応に対するPAS-coreの役割～β1、β2について～ |
2002.03
| 飯田 和俊 | 光合成細菌 Ectothiorhodospira halophilaを用いた光合成的水素発生条件の検討 |
| 郷原 潤三 | 可溶化ロドプシンとアレスチンの相互作用 |
| 塩沢 久美子 | NMRによる光受容蛋白質 Photoactive Yellow Proteinの構造解析 |
| 對比地 久義 | 好塩性紅色硫黄細菌 Ectothiorhodospira halophila由来ニトロゲナーゼのクローニングおよびその解析 |
| 初田 竜也 | 系統的挿入変異体を用いた構造形成、及び機能発現の機構解析～Staphylococcal nucleaseのαへリックスについて |
| 針貝 美樹 | イェロープロテインの光構造変化メカニズムの解析 優秀学生賞受賞 |
| 山本 泰輝 | Photoactive Yellow ProteinにおけるC末端疎水性残基の安定性と光反応への影響 |
2001.03
| 田村 千恵 | X線溶液散乱法によるアレスチンの多量体形成およびアレスチン・ロドプシン複合体の解析 |
| 中川 洋 | Staphylococcal nucleaseを用いて見た蛋白質の構造と動力学の多様性 |
| 安田 早苗 | Photoactive Yellow Proteinの構造・機能に対するC末端領域の役割 |
2000.03
| 大石 真市 | 光受容蛋白質photoactive yellow proteinの安定性と光の効果 |
| 小林 志麻子 | Photoactive Yellow Proteinの構築に必要なアミノ酸残基の検索 |
| 清水 伸隆 | Photoactive Yellow Protein光反応に対する有機酸イオンの効果 |
| 冨田 篤 | レチナールタンパク質の光吸収による構造変化 |
| 野中 洋志 | 進化分子工学的手法によるPhotoactive Yellow Protein改変の試み |
| 平岡 諭 | Photoactive Yellow Protein(PYP)の物性に対するトリプトファンの寄与 |
| 平野 聡 | Staphylococcal Nucleaseの構造形成にはたすC末端部位の役割 |
| 松尾 良介 | アラニン残基の挿入がSNaceに与える影響（6番目のβ構造への挿入） |