研究業績（学会発表）

2014年

第３回物構研サイエンスフェスタ, 茨城県つくば市, 2015年3月17－18日

1. 上久保 裕生
   X線溶液散乱測定用AUTO-SAMPLING装置の開発と応用

The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions, 三重県志摩市, 2015年1月11-12日

1. H. Kamikubo, M.Kataoka
   Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module
2. K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Ptotein
3. Y. Keito, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Relationship of the photoreactions of two sensor domains in PYP-Phytochrome Related Protein
4. H. Tanaka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin
5. A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The elucidation of the relationship between b4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs
6. S. Aoyagi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Characterization of the denatured structure of staphylococcal nuclease by tryptophan triplet state lifetime measurements

第４回生物系科学における学術研究の動向を探る, 北海道千歳市, 2015年1月11日

1. 片岡幹雄
   蛋白質の変性構造を掘る

分子システム研究における溶液散乱, 愛知県岡崎市, 2014年12月20日

1. 上久保裕生
   溶液散乱の出版ガイドラインについて(招待講演)

The 7th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations, Seoul, Korea, 2014年11月26−28日

1. H. Kamikubo
   Molecular actions in the light sensor protein, Photoactive Yellow Protein(招待講演)

OSU Joint Physics/Chemistry/Biochemistry Colloquium/Seminar, Oklahoma State University, 2014年11月5−6日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein

16th　International Conference on Retinal Proteins, 滋賀県長浜市, 2014年10月5−10日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein
2. Y. Yamazaki, Y. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Analysis for different property of light induced structural changes between two PYPs
3. K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Structural change in Arginine 52 of photoactive yellow protein during the photoreaction
4. K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Light-induced structural change of PYP-phytochrome related protein
5. A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The elucidation of the relationship between β4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs

第270回　光ナノサイエンス特別講義, 奈良県生駒市, 2014年10月1日

1. 上久保裕生
   「機能性を生み出す複雑系分子システムの動作機構と構築」

第1回「動的秩序と機能」若手研究会, 宮城県刈田郡蔵王町, 2014年9月28−30日

1. 米澤健人, 上久保裕生, 吉田桂人, 山崎洋一, 片岡幹雄
   Photoactive Yellow Proteinにおけるアルギニン52のプロトン化状態
2. 青柳貞利, 山口真理子, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄
   トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの変性構造の評価
3. 岡部龍二, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄
   マイクロ流路を用いたX線溶液散乱測定サンプルチェンジャーの開発

第52回日本生物物理学会年会, 北海道札幌市, 2014年9月25−27日

1. H. Kamikubo
   Molecular actions of the light sensor protein, Photoactive Yellow Protein, as a prototype for sensor proteins
2. Y. Yamazaki, Y. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Analysis for different property of light induced structural changes between two PYPs
3. K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein
4. K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Relationship of the photoreactions between two sensor domains in PYP-Phytochrome Related Protein
5. R. Okabe, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Development of a microfluidics-based auto-sample changer for solution X-ray scattering
6. H. Tanaka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin
7. S. Aoyagi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Characterization of the denatured structure of staphylococcal nuclease by tryptophan triplet state lifetime measurements
8. A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The elucidation of the relationship between β4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs
9. M. Noji, M. Arakawa, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, . Kataoka
   Acid induced proton transfer in Photoactive Yellow Protein

The 14th KIAS Conference on Protein Structure and Function, Seoul Korea, 2014年9月18−20日

1. H. Kamikubo, M. Kataoka
   The potential uses of structure and function elements (招待講演)

高エネルギー加速器研究機構「第8回大学生のための素粒子・原子核、物質・生命スクール」サマーチャレンジ2014, 茨城県つくば市, 2014年8月23−24日

1. 上久保裕生
   演習「タンパク質の形を見てみよう」
   講義「光散乱・小角散乱に関する基礎」「X線溶液散乱デモデータの処理」

新学術領域研究「動的秩序と機能」班会議, 石川県小松市, 2014年8月4−7日

1. 上久保裕生
   機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査

東京理科大学総合研究機構「分子連関相乗系研究部門」セミナー,東京都新宿区, 2014年7月26日

1. 上久保裕生
   弱い相互作用で関連づけられたタンパク質分子集団の特性と制御(招待講演）

The 2nd International Symposium on Science at J-PARC,つくば市, 2014年7月12−15日

1. M. Kataoka
   Protein Dynamics and Structure Studied by Neutron Scattering(招待講演）

第14回日本蛋白質科学会年会, 横浜市, 2014年6月25−27日

1. 上久保裕生
   マルチドメイン蛋白質におけるドメイン再配置と結合調整
2. 山崎洋一、松本寛史、上久保裕生、片岡幹雄
   Rhodobacter capsulatus PYP結晶構造に見られる活性中間体様構造の解析

8th IUPAP International Conference on Biological Physics, Beijing, China, 2014年6月18−22日

1. M. Kataoka
   FRET Analysis of Denatured Staphylococcal Nuclease(招待講演）

第2回タンパク質X線溶液散乱講習会, つくば市, 2014年6月3−4日

1. 上久保裕生
   BioSAXS論文投稿規定に関して(招待講演）

第47回量子物理化学セミナー兼理数GPセミナー, 横浜市, 2014年6月4日

1. 上久保裕生
   共役した蛋白質分子内プロトン移動反応の実験的検証(招待講演）

2013年

第69回日本物理学会年次大会, 平塚市, 2014年3月27−30日

1. 冨士香奈、藤崎弘士、吉田忠臣、芝るみ、山口真理子、戸田幹人
   核酸分解酵素Staphylococcal nucleaseの分子動力学に対する時系列解析：活性低下における水、リガンド、ループの関係性

SPring-8 ワークショップ「SPring-8とユーザーのさらなる連携を目指して」, 兵庫県佐用郡佐用町, 2014年2月1−2日

1. 上久保裕生
   溶液散乱を用いた多成分平衡系における構造解析(招待講演）

新学術領域研究「動的秩序と機能」第2回国際シンポジウム, 京都市, 2014年1月11−12日

1. H. Kamikubo
   Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module(招待講演)
2. Y. Yamazaki, M. Shimada, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Interaction sites analysis for the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsulatus
3. M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Local disordered structure of staphylococcal nuclease studied by tryptophan triplet state lifetime measurement
4. T. Matsumoto, M. Yamaguchi, R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Loop dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale
5. T. Minemura, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Local flexibility around tryptophan140 and its relationship to non-local interaction in disordered staphylococcal nuclease
6. T. Morimoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Extraction of function elements from green fluorescent protein
7. M. Noji, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Protonation state of R52 at the pypm intermediate state
8. H. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus
9. Y. Matsumoto,　Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Analysis of Equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins
10. E. Ohta, T. Watanabe, T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, T. Hohsaka, M. Kataoka
    Statistical characteristics of unfolded staphylococcal nuclease studied by FRET analysis
11. M. Arakawa, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme

第3回生物系科学における学術研究の動向を探る, 札幌市, 2014年1月12日

1. 片岡幹雄
   蛋白質はどのようにできているか（招待講演）

1st International Picobiology Institute Symposium, Hyogo, 2014年1月07日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein（招待講演）

Sixth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences:Experiments and Simulations, Okazaki, Japan, 2013年11月25−27日

1. H. Kamikubo
   Functional modification of a protein by using element implantaion（招待講演）

GIST-NCTU-NAIST International Joint Symposium 2013, Ikoma, Japan, 2013年11月21−26日

1. D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Excited-state proton transfer in fluorescent Photoactive Yellow Protein containing 7-hydroxycoumarin

分子科学研究所研究会：ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る, 岡崎市, 2013年11月18−19日

1. 山崎洋一
   PYPの分光学的性質の多様性獲得機構
2. 松本芳晃、山崎洋一、上久保裕生、山口真理子、片岡幹雄
   キメラ変異体を用いたPYPの光反応中間体の解析
3. 野路将義､上久保裕生、山崎洋一、山口真理子、片岡幹雄
   水溶液中におけるPYP_M中間体のアルギニン52のプロトン化状態

　

第51回日本生物物理学会年会, 京都市, 2013年10月28−30日

1. M. Kataoka, H. Kamikubo, F. Schotte, H. S. Cho, P. Anfinrud
   Time-resolved Laue crystallography of photoactive yellow protein with 150psec time resolution
2. H. Nakagawa, M. Kataoka
   Translation diffusion dynamics of protein hydration water and its dynamical coupling with protein dynamics
3. M. Deshpande, P. Parui, M. Yamanaka, S.i Nagao, H. Kamikubo, M. Kataoka, H. Komori, Y. Higuchi, S. Hirota
   Domain-Swapped Oligomerization and Molten Globule State of Cytochrome c
4. Y. Yamazaki, M. Shimada, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus
5. R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Maruyama, J. Yunoki, K. Fukuyama, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity
6. D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Exited State Proton Transfer of Fluorescent Photoactive Yellow Protein Reconstituted with Hydroxycoumarin
7. K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein
8. K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   X-ray Solution Scattering Studies of PYP-Phytochrome Related Protein
9. E. Ohta, T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, T. Watanabe, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
   Analysis of unfolded structure of Staphylococcal nuclease mutants by using FRET
10. T. Matsumoto, M. Yamaguchi, R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
    Main-chain dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale
11. T. Minemura, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
    Local flexibility of denatured structure and its relationship to non-local interaction in staphylococcal nuclease
12. T. Morimoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Extraction of Function Elements from Green Fluorescent Protein
13. M. Arakawa, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme
14. H. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus
15. Y. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Analysis of Equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins
16. M. Noji, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Protonation state of R52 at the PYP_M intermediate state

　

生命システムにおける動的秩序形成と高次機能発現　第１回公開シンポジウム, 岡崎市, 2013年10月2日

1. 上久保裕生
   機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール)の動的秩序の探査

日本物理学会2013年秋季大会, 徳島市, 2013年9月25−28日

1. 松本昇紘，山口真理子，芝るみ，上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
   トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの主鎖の運動性評価

The International Conference on Advanced Materials Science and Technology, Yogyakarta, Indonesia 2013年9月17−18日

1. D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Excited-state proton transfer in fluorescent Photoactive Yellow Protein containing 7-hydroxycoumarin

分子・物質合成プラットフォーム技術研修会, 京都市, 2013年8月22日

1. 上久保裕生
   X線溶液散乱法を用いたタンパク質構造の解析　(招待講演）

Telluride Conference on Protein Dynamics 2013, Telluride, USA, 2013年8月5−9日

1. M. Kataoka
   The mechanism of induced folding of Staphylococcal nuclease　(招待講演）

NAIST未来開発コロキウム～明日をつくる分子・人材ネットワーク, 生駒市, 2013年8月9日

1. 上久保裕生
   折り畳み機構を踏まえた蛋白質分子設計法の開発　(招待講演)

国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」第2回研究プログラム, 京都市, 2013年8月8日

1. 上久保裕生
   光センサー蛋白質からみた階層間の連続性

第3回CIMoSセミナー, 岡崎市, 2013年6月28日

1. 上久保裕生
   光センサー蛋白質の局所状態変化と全体構造変化　(招待講演）

第13回日本蛋白質科学会年会，鳥取市， 2013年6月12−14日

1. 上久保裕生
   Photoactive Yellow Protein中の低障壁水素結合と近傍アルギニンの解離性　(招待講演）
2. 芝るみ
   黄色ブドウ球菌由来核酸分解酵素におけるループの揺らぎと機能の関係

8th Asian Biophysics Association Symposium , Jeju, Korea 2013年5月26−29日

1. M. Kataoka
   Is tertiary structure required for a specific function?
2. R. Shiba
   The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity

国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」第1回研究プログラム, 京都市, 2013年4月21日

1. 上久保裕生
   弱い相互作用で関連づけられたタンパク質分子集団の構造学的解析

American Physical Society (APS) March Meeting 2013, Baltimore, USA 2013年3月17−22日

1. M. Kataoka
   Is tertiary structure really required for specific function of a protein?（招待講演）

The 4th Japan-France Joint Symposium "Imaging of spatiotemporal hierarchies in living cells -An overview of dynamics from molecules to cells-", Kouto, Hyogo, Japan, 2013年1月7−11日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein（招待講演）

2012年

第38回量子物理科学セミナー, 横浜, 2012年12月21日

1. 上久保裕生
   結晶構造解析と溶液散乱測定から見た光センサー蛋白質の局所構造と全体構造（招待講演）

The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions（「揺らぎと生体機能」第6回公開シンポジウム）, Kyoto, Japan, 2012年12月5−6日

1. M. Kataoka
   Structure, dynamics and function of staphylococcal nuclease（招待講演）
2. M. Kataoka, H. Nakagawa
   Effect of hydration on protein dynamics
3. R. Shiba, H. Kamikubo, J. Yunoki, K. Fukuyama, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The role of the flexible loop in staphylococcal nuclease on its catalytic activity
4. D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Fluorescence properties of chromophore-modified photoactive yellow protein
5. E. Ohta, T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, K. Shiraga, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
   The comparison of fluorescent spectra between wild type staphylococcal nuclease and the mutants based on FRET
6. N. Kohzuki, H. Kamikubo, T. Aizawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Amyloid fibril inhibition mechanism of human calcitonin
7. M. Sakonji, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Extraction of the structure elements from PYP
8. M. Shimada, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Analysis of interaction sites on the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsulatus with chimeric proteins
9. M. Narumi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Roles of hydrogen bonds around chromophore in photoactive yellow protein studied by OH-deficient cinnamic acid
10. K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Structural analysis of PYP-phytochrome related protein during its photoreaction by using small angle X-ray scattering
11. K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, S. Yamaguchi, T. Tamada, K. Kurihara, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Protonation state of arginine 52 near the low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein

Nikko Joint Conference between 10th International Conference on Quasielastic Neutron Scattering and 5th Workshop on Inelastic Neutron Spectrometers (QENS & WINS 2012), Nikko, Japan, 2012年9月30日−10月4日

1. M. Kataoka
   Protein dynamics and hydration water（招待講演）

第50回日本生物物理学会年会, 名古屋, 2012年9月22−24日

1. H. Kamikubo, E. Sakai, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Element-based molecular design can reproduce an artificial protein with an expected enzymatic activity
2. Y. Yamazaki, M. Shimada, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The role of hydrogen bonding network around the chromophore for the interaction of Rc-PYP
3. R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity
4. N. Kouduki, H. Kamikubo, T. Aizawa, Y. Ogawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Amyloid fibril inhibition mechanism of human calcitonin
5. M. Sakonji, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Effect of N-terminal region to the structure formation of PYP
6. M. Shimada, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus with chimeric proteins
7. M. Narumi, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Roles of hydrogen bonds around chromophore in Photoactive Yellow Protein studied by OH-deficient cinnamic acid
8. K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Photoreaction of PYP domain regulates the structural change during the photoreaction of phytochrome domain of Ppr
9. K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, S. Yamaguchi, T. Yamada, K. Kurihara, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Protonation state of arginine 52 near the low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein
10. H. Nakagawa, M. Kataoka
    Kinetics of hydrogen-bonding of protein hydration water and its dynamical coupling with protein dynamics

新学術領域研究合同公開シンポジウム「ゆらぎと水－生命のエネルギーと機能の分子機構を探る」, 大阪, 2012年9月14−15日

1. 片岡幹雄，中川洋
   水和がタンパク質動力学に与える影響

第12回日本蛋白質科学会年会, 名古屋, 2012年6月20-22日

1. 芝るみ，上久保裕生，梅山美香，政さやか，山崎洋一，山口真理子，巌倉正寛，片岡幹雄
   網羅的アラニン挿入変異解析法を用いたジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現及び構造形成領域の抽出

4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations, Nara, Japan, 2012年1月9−11日

1. M. Kataoka, H. Kamikubo, T. Hatsuda, M. Nakayama, N. Minamimura, S. Kayamura, C. Komeda, E. Sakai
   Molecular Anatomy of Staphylococcal Nuclease（招待講演）

The 5th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions（「揺らぎと生体機能」第5回公開シンポジウム）, Nara, Japan, 2012年1月7−8日

1. T. Muto, E. Ohta, Y. Kishi, M. Yamaguchi, K. Shiraga, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
   Incorporation of Fluorescent Non-natural Amino Acids into Staphylococcal Nuclease for FRET Analyses of Induced Folding
2. H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Nishiguchi, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The Roles of the Low Barrier Hydrogen Bond Involved in the Light Sensor Protein, Photoactive Yellow Protein
3. M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Study on the Denatured Structure of Staphylococcal Nuclease by Using Tryptophan Triplet State Quenching
4. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
   Refinement of Function Element of Dihydrofolate Reductase by the Systematic Alanine Insertion
5. S. Ueynagi, H. Kamikubo, Y. Ogawa, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Comparison of Structural Elements between Staphylococcal Nuclease and the C-terminal Domain of Human p100
6. T. Okada, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Denatured Structure of Staphylococcal Nuclease Studied by Quenching of Tryptophan Triplet State by Cysteine
7. R. Odani, Y. Yamazaki, K. Matsumoto, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The Role of N-terminal Region for Photoreaction of Various Photoactive Yellow Proteins
8. E. Sakai, H. Kamikubo, A. Kogasaka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Attempt of Functional Modification of a Protein by Element Implantation
9. Y. Nishiguchi, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Geometric Restriction Facilitates LBHB Formation in Photoactive Yellow Protein

2011年

Prospects of Quantum Beam Sciences at IMSS -Strongly Correlated Systems and Future ERL Science（物構研シンポジウム'11 量子ビーム化学の展望）, Tsukuba, Japan, 2011年12月6−7日

1. M. Kataoka
   The formation and role of low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein（招待講演）

1st Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering, Tsukuba, Japan, 2011年11月20−24日

1. H. Kamikubo, M. Kataoka
   Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds involved in Photoactive Yellow Protein（招待講演）

2011 GIST-NAIST-NCTU Joint Symposium on Advanced Materials, Gwangju, Korea, 2011年11月14−21日

1. H. Kamikubo
   Phyisicochemical properties of low barrier hydrogen bonds involved in proteins（招待講演）

17th International Biophysics Congress (IUPAB), Beijing, China, 2011年10月30日−11月3日

1. H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Nishiguchi, K. Yonezawa, K. Kurihara, T. Tamada, M. Kataoka
   The roles of the low barrier hydrogen bond involved in Photoactive Yellow Protein
   （Best Poster Award受賞）
2. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
   Refinement of function element of dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
   （Best Poster Award受賞）
3. M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Local structural change of staphylococcal nuclease wild type and its non-native mutant with guanidine hydrochloride monitored by tryptophan triplet quenching
4. S. Ueyanagi, H. Kamikubo, Y. Ogawa, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Comparison of structural elements between Staphylococcal nuclease and the C-terminal domain of Human p100

特定領域研究「高次系分子科学」第12回ミニ公開シンポジウム「光受容蛋白質」, 蒲郡, 2011年10月26−27日

1. 上久保裕生
   活性部位近傍に存在する水素結合と高次構造転移（招待講演）

日本分光学会テラヘルツ分光部会シンポジウム「テラヘルツ分光法の最先端V」～バイオテラヘルツ分光～, 横浜, 2011年9月28−29日

1. 片岡幹雄
   タンパク質動力学と水和（招待講演）

第49回日本生物物理学会年会, 姫路, 2011年9月16−18日

1. Y. Yamazaki, M. Hayashi, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Solution structure of the complex states of Rhodobacter capsulatus PYP with its binding protein
2. M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Difference in local structure between staphylococcal nuclease wild type and its non-native mutant studied by tryptophan triplet quenching
3. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
   Classification of function element of dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
4. S. Ueyanagi, H. Kamikubo, Y. Ogawa, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Comparison of structural elements between Staphylococcal nuclease and the C-terminal domain of Human p100
5. T. Okada, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Denatured Structure of Staphylococcal Nuclease Studied by Triplet State Quenching of Tryptophan by Cysteine
6. R. Odani, Y. Yamazaki, K. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The Role of N-terminal Region for Photoreaction of Various Photoactive Yellow Proteins
7. E. Sakai, H. Kamikubo, A. Kogasaka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Attempt of functional modification of a protein by element implantation
8. S. Setoguchi, H. Kubo, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Development of Light dependent protein activity control system by use of interaction of the Rc-PYP
9. Y. Nishiguchi, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, T. Tamada, K. Kurihara, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Analysis of low barrier hydrogen bond in Photoactive Yellow Protein, Geometric restriction facilitates LBHB formation in PYP
10. T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, K. Shiraga, I. Iijima, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hosaka, M. Kataoka
    Structural Analysis of Intrinsically Disordered Protein Model using FRET
11. S. Nagao, Y. Hattori, M. Ueda, M. Taketa, H. Osuka, H. Komori, H. Kamikubo, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi, S. Hirota
    Cytochrome c polymerization by domain swapping

合同PF研究会「PFにおけるマイクロビームを利用した XAFS, XRF, SAXS実験の展望」, つくば, 2011年9月8−9日

1. 上久保裕生
   構造生物学における放射光X線溶液散乱（招待講演）

Telluride Conference on Protein Dynamics 2011, Telluride, USA, 2011年8月1−5日

1. M. Kataoka
   Is tertiary structure required for a specific function?（招待講演）

九重分光関連夏期セミナー2011, 九重, 2011年7月29日−31日

1. 上久保裕生
   蛋白質中の低障壁水素結合と高次構造転移（招待講演）

KOUJIKEI 5th Symposium（特定領域研究「分子高次系機能解明のための分子科学」第5回国際公開シンポジウム）, Sapporo, Japan, 2011年7月11−13日

1. H. Kamikubo
   Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds（招待講演）

3rd Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations, Cheju-do, Korea, 2011年2月27日−3月1日

1. M. Kataoka
   High resolution neutron crystallography of photoactive yellow protein　-Discovery of low barrier hydrogen bond（招待講演）

The 7th Asian Biophysics Association (ABA) Symposium, New Delhi, India, 2011年1月30日−2月2日

1. M. Kataoka
   High resolution neutron crystal structure of photoactive yellow protein: Discovery of low barrier hydrogen bond（招待講演）

2010年

International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2010), Honolulu, USA, 2010年12月15−20日

1. M. Kataoka
   Low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein and its role in photoreaction（招待講演）

特定領域研究「分子高次系機能解明のための分子科学」第4回公開シンポジウム，仙台，2010年11月25−26日

1. 上久保裕生
   蛋白質中に存在する低障壁水素結合の特性解析

The 4th International Symposium "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions", Otsu, Japan, 2010年11月30日－12月1日

1. H. Kamikubo, S. Tadokoro, M. Kataoka
   Fluctuation controls enzymatic activity of Staphylococcal nuclease
2. M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Measurements of loop formation in the denatured state of staphylococcal nuclease
3. H. Sawada, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   The investigation of the relationship between non-local interaction and the effect of single alanine insertion in staphylococcal nuclease
4. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Iwakura, M. Kataoka
   Classification of the functional element of dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
5. Y. Kishi, T. Muto, M. Yamaguchi, I. Iijima, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
   FRET analysis of structural changes in staphylococcal nuclease
6. Z. Wang, Y. Hattori, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi, S. Hirota
   Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix

日本物理学会2010年秋季大会，堺，2010年9月23日

1. 片岡幹雄
   蛋白質機能の発現に構造は必須か？（招待講演）
2. 中川洋，片岡幹雄
   中性子非弾性散乱と分子動力学によるタンパク質の揺らぎと水和水ダイナミクスの研究

第48回日本生物物理学会年会，仙台，2010年9月20−22日

1. M. Kataoka
   The mechanism of induced folding of Staphylococcal nuclease: Folding before binding or binding before folding?（招待講演）
2. H. Kamikubo, A. Kogasaka, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Synthesis of an artificial enzyme by implanting the functional elements of SNase
3. Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Substitution effects of basic residues in the photoactive yellow protein of Rhodobacter caplsulatus
4. M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Urea denaturation of staphylococcal nuclease monitored by tryptophan-cysteined distance
5. H. Sawada, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The investigation of the relationship between non-local interaction and the effect of single alanine insertion in staphylococcal nuclease
6. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
   Classification of the functional element of dihydrofolate reductase (DHFR) by the systemic alanine insertion
7. Y. Ogawa, H. Kamikubo, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Property of a structural element of SNase-like domain in human p100
8. C. Ahn, H. Kamikubo, H. Yoshioka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   The role of each residue in the flexible lambda loop of Staphylococcal nuclease on the catalytic activity
9. Y. Kishi, M. Yamaguchi, I. Iijima, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
   FRET analysis of structural changes in Staphylococcal nuclease
10. M. Naruse, H. Kamikubo, S. Kametaka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, S. Waguri, S. Wakatsuki, M. Kataoka
    Solution structural analysis of Drosophila GGA
11. M. Hayashi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
    Analysis of solution state of the interaction protein of Rc-PYP
12. J. Miura, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Solution structure of the light sensor histidine kinase of Ppr comprised of the PYP and Bph domains
13. S. Hirota, Y. Hattori, S. Nagao, M. Takeda, H.i Komori, H. Kamikubo, Z. Wang, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
    Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix
14. D. Hamada, H. Kamikubo, Y. Hagihara, M. Kataoka
    Intrinsically less-ordered bacterial effectors: A case of EspB from enterohaemorrhagic Escherichia coli
15. T. Masui, S. Fujiwara, H. Nakagawa, M. Kataoka
    Effects of trehalose on the structures and dynamics of lipid membrane

第16回日本光生物学協会年会，吹田，2010年8月10−11日

1. 山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
   Photoactive Yellow Proteinにおける発色団の機能変調

The 4th Shanghai International Conference on Biophysics and Molecular Biology, Shanghai-Jiashan, China, 2010年8月8−11日

1. M. Kataoka, H. Nakagawa
   Effect of hydration water on protein dynamics（招待講演)
2. H. Sawada, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   The effect of alanine insertion mutation for folding process
3. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Iwakura, M. Kataoka
   Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
   （Best Poster Award受賞）

第10回日本蛋白質科学会年会，札幌，2010年6月16−18日

1. 芝るみ，上久保裕生，梅山美香，政さやか，山口真理子，山崎洋一，巌倉正寛，片岡幹雄
   網羅的アラニン挿入変異解析法を用いたジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現及び構造形成領域の抽出
2. 萩原義久，井上直和，浜田大三，上久保裕生，平田邦生，片岡幹雄，山本雅貴，伊川正人，岡部勝
   精子由来蛋白質IZUMO，その構造と受精膜融合での役割

Leopoldina-Symposium on the Complexity Connecting Biomolecular Structure and Solvation Dynamics, Bochum, Germany, 2010年5月25−27日

1. M. Kataoka
   Effect of hydration on protein dynamics（招待講演）

特定領域研究「高次系分子科学」第5回合同班会議，南あわじ，2010年5月24−26日

1. 上久保裕生
   蛋白質中に存在する低障壁水素結合の特性解析

第2回生命物質構造解析研究会，東海村，2010年3月25日

1. 上久保裕生
   中性子結晶構造解析による蛋白質分子内プロトン移動機構の解明（招待講演）

分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から“何がわかるか”“何をもたらすか”」，岡崎，2010年3月23−24日

1. 上久保裕生
   分子内プロトン移動：Photoactive Yellow Proteinの水素結合構造から何がわかるのか（招待講演）

2009年

The 3rd International Symposium on "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions"（第3回“揺らぎと生体機能”公開シンポジウム），名古屋大学豊田講堂，名古屋，2009年12月20−21日

1. M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   The properties required for the binding before folding mechanism of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease
2. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
   Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
3. H. Sawada, S. M. Budamagunta, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, C. J. Voss, M. Kataoka
   Structural characterization of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease by electron paramagnetic resonance spectroscopy
4. M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Local structure characterization of staphylococcal nuclease by lifetime measurement of tryptophan triplet state
5. Y. Ogawa, H. Kamikubo, C. Komeda, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Extraction of the structural element of SNase-like domain in human p100 by alanine insertion analysis

日本中性子科学会第9回年会，いばらき量子ビーム研究センター，東海村，2009年12月9−10日

1. 上久保裕生
   中性子結晶構造解析による蛋白質中の低障壁水素結合の発見（依頼講演）

The 1st NCTU-NAIST Workshop on "Molecular/Nano Science", National Chiao Tung University, Hsinchu, Taiwan, 2009年11月11−13日

1. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein and its role in photoreaction（招待講演）
2. H. Sawada, M. S. Budamagunta, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, J. C. Voss, M. Kataoka
   Structural characterization of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease by electron paramagnetic resonance spectroscopy

第47回日本生物物理学会年会，アスティとくしま，徳島，2009年10月30日−11月1日

1. 山口繁生
   Low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein（若手招待講演）
2. 片岡幹雄
   Detection of thermal fluctuations of protein by neutron inelastic scattering（シンポジウム招待講演）
3. H. Kubo, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Light dependent enzyme activity control by use of interaction of the Rc-PYP
4. Y. Yamazaki, N. Ota, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Interaction mechanism of the photoactive yellow protein of Rhodobacter caplsulatus
5. Y. Hamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The low-temperature spectroscopy of Rc-PYP
6. K. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Analysis of the different properties in two PYPs by use of chimera proteins
7. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, R. Kuroki, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein
8. H. Yoshioka, S. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Crystallographic study of the alanine insertion mutants of Staphylococcal nuclease
9. A. Kogasaka, H. Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
   Attempt to create an artificial functional protein by exchange of functional elements
10. K. Saito, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    Direct structural modulation of the structure element of SNase by using the azobenzene linkage
11. M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
    F-value analysis of induced folding: The role of the ligand binding in induced folding of disordered staphylococcal nuclease mutant
12. H. Sawada, S. M. Budamagunta, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, C. J. Voss, M. Kataoka
    Structural characterization of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease by electron paramagnetic resonance spectroscopy
13. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
    Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
14. Y. Ogawa, H. Kamikubo, C. Komeda, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
    Extraction of the structural element of SNase-like domain in human p100 by alanine insertion analysis
15. H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, M. Kataoka
    Hydration affects both harmonic and anharmonic nature of protein dynamics

The 3rd UT Horiba International Symposium on Hydrogen and Water in Condensed Matter Physics，生命の森リゾート，千葉，2009年10月12−16日

1. M. Kataoka
   Effect of Hydration Water on Protein Dynamics

Telluride Science Research Center (TSRC) Workshop on Protein Dynamics 2009, Telluride Intermediate School, Telluride, CO, USA, 2009年8月3日−7日

1. M. Kataoka
   Low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein and its role in photoreaction（招待講演）

第36回生体分子科学討論会，北海道大学，札幌，2009年6月19−20日

1. 片岡幹雄、上久保裕生、山口繁生
   イェロープロテインの低障壁水素結合の形成とその役割

第9回日本蛋白質科学会年会，熊本全日空ホテルニュースカイ，熊本，2009年5月20−22日

1. 片岡幹雄
   蛋白質動力学に対する水和の効果（招待講演）

The 2nd International Symposium on "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions"（第2回“揺らぎと生体機能”公開シンポジウム），岡崎コンファレンスセンター，岡崎，2009年3月16−17日

1. M. Kataoka
   Effect of Hydration on Protein Dynamics Studied by Neutron Scattering（招待講演）
2. Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka, A. Kitao
   Dynamics of protein hydration water studied from the simulated coherent neutron scattering spectra
3. H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, M. Kataoka
   Structure and dynamics of the protein hydration water at the protein dynamical transition
4. M. Yamaguchi, K. Yamamoto, M. Tani, M. Hangyo, M. Kataoka
   Dielectric spectra of hydrated water in the terahertz range

ATI International Forum 2009 "Protein Structure Determination and Applications"，リコッティ東海，東海村，2009年3月9−10日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein: Direct observation of low barrier hydrogen bond and its roles（招待講演）

The 6th Asian Biophysics Association (ABA) Symposium, 香港科学技術大学、Hong Kong, 2009年1月11−15日

1. M. Kataoka
   Mechanism of Induced Folding of Staphylococcal Nuclease: Implication to Natively Unfolding Protein（招待講演）
2. H. Kamikubo, S. Yamaguchi, K. Kurihara, R. Kuroki, N. Niimura, N. Shimizu, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Neutron and X-ray crystallographic study of photoactive yellow protein
3. H. Nakanishi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Interaction between BLUF domain and the C-terminal region of AppA
4. N. Ota, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   N-terminal deletion effect in the Rc-PYP
5. S. Tadokoro, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Influence of loope modification in staphylococcal nuclease on its structure and activity

第1回“揺らぎと生体機能”公開シンポジウム，京都テルサ，京都，2009年1月6日

1. 片岡幹雄
   天然変性蛋白質のモデル系開発と揺らぎと構造形成相関の解析（招待講演）

2008年

第46回日本生物物理学会年会，福岡国際会議場，福岡，2008年12月3−5日

1. S. Tadokoro, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   The role of theflexible loop in staphylococcal nuclease on its catalyticactivity
2. R. Nakagaki, H.Kamikubo, Y. Yamazako, M. Kataoka
   Role of leucine 108 for the folding of staphylococcal nuclease
3. H. Sawada, H.Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazako, M. Kataoka
   The effect of alanine insertion mutation for folding kinetics
4. Y. Yamazaki, H.Kamikubo, M. Kataoka
   Spectral characterization of the complex form of the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsolatus
5. H. Kamikubo, T. Koyama, M. Hayashi, K. Shirai, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   The phtotreaction of the PYP domain in the light sensor histidine kinase Ppr is influenced by the C-terminal domain
6. N. Ota, Y. Yamazako, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Role of the N-terminal cap in the Rc-PYP
7. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, R. Kuroki, N. Niimura, N. Shimizu, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Direct observation of two distinct types of short hydrogen bond in photoactive yellow protein
8. C. Komeda, Y. Yamazako, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Foldability of SNase-like domain in human p100
9. R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Iwakura, M. Kataoka
   Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
10. Javaid Shahbaz Khan, M. Terazima, M.Kataoka, M. Harigai, Y. Shichica, Y. Imamoto
    The origin of conformational changes of the PYP photoreaction monitored by diffusion change
11. Y. Yamada, H. Tsuihiji, K. Shirai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
    Identification of the structural and functional element of photoactive yellow protein
12. H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, M. Kataoka
    Structure and dynamics of the protein hydration water at the protein dynamical transition
13. H. Nakanishi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
    Intramolecolar interaction for light-responsible regolation in AppA

The 150th Anniversary of Japan-France Relationship Workshop on Water & Cell Physiology, ウェスティン都ホテル京都，京都，2008年11月25−26日

1. M. Kataoka
   Effect of hydration water on protein dynamics（招待講演）

JSPS Japan-France Bilateral Joint Seminar 2008 "Frontiers of Glassy Physics", 京都大学基礎物理学研究所，京都，2008年11月19−22日

1. M. Kataoka
   Effect of hydration on the glass-like transition of protein（招待講演）

Asia Science Seminar on "Frontier Science at High-Intensity Proton Accelerators", China Center of Advanced Science and Technology, Beijing, China, 2008年10月19−25日

1. M. Kataoka
   Protein Dynamics and Structure Studied by Neutron Scattering（基調講演）
2. H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, M. Kataoka
   Structure and dynamics of the protein hydration water at the protein dynamical transition

Symposium on Neutron Protein Crystallography (NPC) -Current Status and Future Prospect-, JAEA Ricotti, Tokai, Japan, 2008年8月21−22日

1. H. Kamikubo
   Direct observation of two distinct types of short hydrogen bond in Photoactive Yellow Protein（招待講演）

Workshop Biomolecolar Dynamics and Protein-Water Interactions, Internatinal Education Center Feldafing, Munich, Germany, 2008年9月24−26日

1. M. Kataoka
   Effect of hydration and conformational state on protein dynamics（招待講演）

第8回日本蛋白質科学会年会，タワーホール船堀，東京，2008年6月10−12日

1. 片岡幹雄
   Staphylococcal nucleaseの誘導折り畳み機構（ワークショップ招待講演）

55回応用物理学関係連合講演会，日本大学理工学部，船橋，2008年3月27−30日

1. 片岡幹雄
   中性子散乱によるタンパク質動力学の研究（シンポジウム、招待講演）

Gordon Research Conference on Photosensory Receptors & Signal Transduction 2, Crowne Plaza Hoter Ventura, Ventura, CA, USA, 2008年1月27日−2月1日

1. M. Kataoka
   Structure of the photointermediate of PYP and the propagation mechanism of structural change（招待講演）

2007年

第45回生物物理学会年会，パシフィコ横浜，横浜，2007年12月21−23日

1. S. J. Kahn，寺嶋正秀，片岡幹雄，針貝美樹，七田芳則，今元泰
   光サイクルの構造変化におけるPhe6とLys123の役割
2. 上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
   研究室系X線溶液散乱回折装置の立ち上げ
3. 鬼塚正義，上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
   C末端欠損スタフィロコッカルヌクレアーゼが示す誘導折り畳み反応の分子メカニズム
4. 澤田宏起，上久保裕生，鬼塚正義，山崎洋一，片岡幹雄
   アラニン挿入変異が折れ畳み過程に及ぼす影響
5. 政さやか，上久保裕生，梅山美香，山崎洋一，巌倉正寛，片岡幹雄
   ジヒドロ葉酸還元酵素におけるフォールディングエレメントや活性部位の接続部位に含まれる情報の抽出
6. 芝るみ，上久保裕生，梅山美香，山崎洋一，巌倉正寛，片岡幹雄
   網羅的アラニン挿入変異法によるジヒドロ葉酸還元酵素の構造形成および機能発現領域の抽出
7. 中川洋，片岡幹雄
   パーコレーション転移における蛋白質水和水の構造とダイナミクス
8. 針貝美樹，山崎洋一，片岡幹雄，今元泰
   Photoactive Yellow Proteinの光反応におけるVal122の作用
9. 浴口真幸，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
   Rhodobacter capsolatus由来PYPの光反応におけるpH依存性
10. 小山知則，上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
    紅色光合成細菌Rhosospirillum centenum由来PYP様ドメインの光反応サイクルの特性
11. 永田大介，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
    Ala/ValスキャニングによるPhotoactive Yellow Proteinの構造・機能に対する重要なアミノ酸残基のマッピング
12. 山口繁生，上久保裕生，栗原和男，山崎洋一，大西裕季，黒木良太，新村信雄，片岡幹雄
    Photoactive Yellow Proteinを用いた中性子結晶構造解析
13. 今元泰，V. Kovaleva，笹山裕晃，針貝美樹，片岡幹雄
    イエロープロテインの光反応サイクルにおける構造変化メカニズム
14. 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
    Rhodobacter capsolatus PYPの分光学的特性の解析

International Workshop on Unifying Concepts of Glass Transition，九州大学，福岡，2007年11月22−24日

1. M. Kataoka
   Effect of hydration on the glass-like transition of protein（招待講演）

The 2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology，東京，2007年9月10−13日

1. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Ohnishi, R. Kuroki, N. Niimura, M. Kataoka
   Determination of hydrogen positions of photoactive yellow protein

The 9th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation, Manchester Bridgewater Hall, Manchester, UK, 2007年8月12−17日

1. H. Kamikubo, K. Hirako, H. Sawada, M. Kawasaki, R. Kato, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
   Solution structural analysis of GGA(VHS-GAT) and the complexes with its binding partners using solution X-ray scattering
2. H. Kamikubo, H. Sawada, M. Kataoka
   Wide angle X-ray solution scattering reveals the structure of photointermediate of photoactive yellow protein
3. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Ohnishi, R. Kuroki, N. Niimura, M. Kataoka
   Determination of hydrogen positions of photoactive yellow protein

Telluride Conference on Protein Dynamics, Telluride, CO, USA, 2007年7月30日−8月3日

1. M. Kataoka
   Structure of the photointermediate of photoactive yellow protein revealed by wide-angle X-ray solution scattering and fluctuation analysis（招待講演）

14回日本光生物学協会年会，奈良先端科学技術大学院大学ミレニアムホール，生駒，2007年7月30−31日

1. 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   光合成細菌Rhodobacter capsolatus 由来PYPの分光学的特性

日本化学会第87春季年会，関西大学，吹田，2007年3月25−28日

1. 片岡幹雄
   蛋白質溶液構造・揺らぎと機能（第二次先端ウォッチングイブニングセッション、招待講演）

日本物理学会2007年春季大会，鹿児島大学，鹿児島，2007年3月18−21日

1. 山口繁生，上久保裕生，清水伸隆，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive Yellow Proteinを用いた中性子回折実験及び高分解能X線結晶構造解析
2. 中川洋，城地保昌，北尾彰朗，柴田薫，郷信広，片岡幹雄
   非干渉性中性子散乱によるタンパク質の動力学転移における水和水の挙動解析

The 3rd Japan-France Joint Seminar on Protein Dynamics, ESRF講堂, Grenoble, France, 2007年1月15−19日

1. M. Kataoka
   Structure of the photointermediate of photoactive yellow protein and the propagation mechanism of structural change（招待講演）

2006年

The 4th Open Workshop "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecoles" （第4回“水と生体分子”公開ワークショップ），京都テルサ，京都，2006年12月18−19日

1. Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka, A. Kitao
   Effects of solvent on protein dynamics studied by molecolar dynamics simolation of crystalline staphylococcal nuclease
2. D. Kitamura, Y. Yamazaki, K. Shirai, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
   The effect of simplified amino acid sequence on conformational stability and catalysis of staphylococcal nuclease
3. H. Tsuihiji, H. Kamikubo, K. Shirai, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Investigation of the structural and functional regions of photoactive yellow protein by using systematic alanine insertion
4. H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, K. Shibata, N. Go, M. Kataoka
   Dynamics of protein and its hydration water studied by incoherent neutron inelastic scattering
5. Y. Hoshihara, Y. Imamoto, M. Kataoka, F. Tokunaga, Y. Kimura, M. Terazima, Pressure effect on photoreaction dynamics of photoactive yellow protein
6. M. Umeyama, H. Kamikubo, M. Iwakura, M. Kataoka
   Extraction of the essential regions of dihydrofolate reductase sequence by alanine insertion perturbation analysis
7. S. Kato, H. Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Elucidation of the unfolding-state and the folding process of the disolfide-bond introduced mutant of staphylococcal nuclease
8. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Preparation of large crystal of photoactive yellow protein for neutron diffraction and high resolution crystal structure analysis
9. K. Hirako, H. Kamikubo, M. Kawasaki, R. Kato, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
   Structural analysis of GGA(VHS-GAT)?Arf complex using SAXS measurement

The 3rd Asia and Oceania Conference on Photobiology, Beijing, China, 2006年11月17−20日

1. Y. Imamoto
   Spectroscopic characterization of the light-induced structuralchange of photoactive yellow protein（招待講演）
2. H. Kamikubo
   Structural characterization of the active state of Photoactive yellow protein using the wide-angle x-ray scattering（招待講演）

第44回生物物理学会年会，沖縄コンベンションセンター，那覇，2006年11月12−16日

1. H. Kamikubo, M. Kataoka
   Structural characterization of an active state using the wide-angle solution X-ray scattering（シンポジウム招待講演）
2. H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, K. Shibata, N. Go, M. Kataoka
   Hydration related protein dynamics studied by incoherent neutron inelastic scattering
3. A. Tokuhisa, Y. Joti, H. Nakagawa, A. Kitao, M. Kataoka
   Molecolar simolation study of the origin of non-Gaussian behavior on the elastic incoherent neutron scattering from protein dynamics
4. M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Characterization of conformational rearrangement during the folding process of Staphylococcal nuclease
5. M. Umeyama, H. Kamikubo, M. Iwakura, M. Kataoka
   Extraction of the essential regions of dihydrofolate reductase sequence by alanine insertion perturbation analysis
6. K. Shirai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Attempt to understand the information encoded in the amino acid sequence of photoactive yellow protein by the simplification of sequence
7. H. Tsuihijji, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
   The relationship between conformation and activity of NifA
8. Y. Hoshihara, Y. Imamoto, M. Kataoka, F. Tokunaga, Y. Kimura, M. Terazima
   Kinetics of major conformational change of PYP
9. K. Hirako, H. Kamikubo, M. Kawasaki, R. Kato, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
   Structural analysis of GGA(VHS-GAT)-Arf complex using SAXS measurement
10. S. Kato, H. Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
    Elucidation of the unfolding-state and the folding process of the disolfide-bond introduced mutant of staphylococcal nuclease
11. Y. Ikeda, J. Gohara, Y. Imamoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, T. Kawakami, S. Yoshimura, S. Aimoto, M. Kataoka
    Interaction of arrestin with phosphorylated rhodopsin C-terminus peptide
12. S. Ano, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
    Elucidation of interaction domains for AppA-PpsR complex
13. S. Yamaguchi, H. Kamikubo, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
    Neutron diffraction and high resolution X-ray crystal structure analysis of photoactive yellow protein
14. Y. Imamoto, H. Sasayama, M. Harigai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
    Conformational change of b5-b6 loop during the photocycle of photoactive yellow protein
15. M. Harigai, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
    Correlation between photocycle kinetics of PYP and conformation of b4-b5 loop
16. T. Morimoto, M. Harigai, Y. Imamoto, M. Kataoka
    The photocycle of Met100Ala mutant of photoactive yellow protein studied by low-temperature spectroscopy
17. Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
    Isolation of photoactive yellow protein associated protein from Rhodobacter capsolatus

The 6th KIAS Conference on Protein Structure and Function, Korean Institute for Advanced Science, Seool, Korea , 2006年10月26−28日

1. M. Kataoka
   The mechanism of inhibitor-induced folding of staphylococcal nuclease（招待講演）

Biochemistry and Molecolar Biology of Sensor Enzymes and Proteins (Satellite Meeting of the 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecolar Biology and 11th FAOBMB Congress), 東北大学多元物質科学研究所講堂，仙台，2006年6月15−16日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein（招待講演）

2005年

2005年第43回生物物理学会年会，札幌コンベンションセンター，札幌，2005年11月23−25日

1. 今元泰
   細菌の光センサーのPASドメイン：イエロープロテイン
2. 片岡幹雄，城地保昌
   次世代の分光技術がもたらす構造生物学の新展開　―生体高分子の動的構造解析から分子機能解明を目指して
3. 馬場隆，上久保裕生，鬼塚正義，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal nucleaseの折り畳み反応におけるグリセロール添加の効果
4. 柴田薫，中川洋，藤原悟，城地保昌，片岡幹雄
   非干渉性中性子非弾性散乱によるニワトリ卵白リゾチームのダイナミクスの研究
5. 今元泰，針貝美樹，片岡幹雄
   イエロープロテインの光反応サイクルのpH依存性
6. 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   紅色光合成細菌Rhodobacter capsolatus由来PYPの光反応の解析と生理条件下における反応の考察
7. 笹山裕晃，針貝美樹，上久保裕生，山崎洋一，今元　泰，片岡幹雄
   イエロープロテインにおける発色団ループの役割
8. 針貝美樹，今元　泰，片岡幹雄
   PYPにおけるN末端部とC末端部との相互作用が光反応に与える影響
9. 上久保裕生，川崎政人，加藤龍一，中山和久，若槻壮市，片岡幹雄
   アダプター蛋白質GGAの自己阻害機構の構造学的検証
10. 坂本亜沙美，山崎洋一，白井久美子，上久保裕生，今元　泰，片岡幹雄
    Photoactive Yellow Proteinにおけるアミロイド線維形成
11. 鬼塚正義，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
    スタフィロコッカルヌクレアーゼの折り畳み過程におけるサブドメイン間相互作用形成の検証
12. 中川洋，城地保昌，片岡幹雄，郷信広
    分子動力学計算で調べたタンパク質の動力学転移に対する圧力効果
13. 加藤真悟，上久保裕生，鬼塚正義，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
    スタフィロコッカルヌクレアーゼの折り畳み過程における長距離相互作用の役割
14. 徳久淳師，城地保昌，上久保裕生，中川洋，北尾彰朗，片岡幹雄
    非干渉性弾性中性子散乱実験に見られる非ガウス性からの蛋白質ダイナミクス情報抽出の試み
15. 中田浩司，白井久美子，今元泰，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
    単純化されたアミノ酸配列を持つPYPの機能回復
16. 山口繁生，上久保裕生，清水伸隆，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
    中性子結晶構造解析に用いるPYP結晶の調整

第12回日本光生物学協会年会，京都大学・京都テルサ，京都，2005年8月5−7日

1. 今元泰，針貝美樹，片岡幹雄
   PASドメイン蛋白質・イエロープロテインの光反応サイクル
2. 中田浩司，白井久美子，今元泰，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
   単純化されたアミノ酸配列を持つPYPの機能回復

The 2nd Open Workshop "Chemistry of Biological Proesses Created by Water and Biomolecoles", Kokuyo Hall, Tokyo, Japan, 2005年3月17-18日

1. A. Tokuhisa, Y. Joti, H. Kamikubo, H. Nakagawa, A. Kitao, M. Kataoka
   Correlation between Protein Dynamics and the Elastic Incoherent Neutron Scattering Profile Studied by Molecolar Dynamics Simolation
2. T. Oka, K. Inoue, M. Kataoka, N. Yagi
   Structural Transition of Bacteriorhodopsin is Preceded by Deprotonation of Schiff Base: Microsecond Time-Resolved X-ray Diffraction Study of Purple Membrane
3. K. Shirai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
   An Attempt to Understand the Information Encoded in the Amino Acid Sequence of Photoactive Yellow Protein by the Simplification of Sequence
4. M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   The Mechanism of Substrate-Induced Folding of Staphylococcal Nuclease
5. M. Nakayama, M. Kataoka
   Effects of Alanine Insertion on the Structure Formation and Enzymatic Activity of Staphylococcal Nuclease
6. A. Sakamoto, Y. Yamazaki, K. Shirai, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Photoactive Yellow Protein can Form Amyloid Fibrils

2004年

2004年第42回生物物理学会年会，国立京都国際会館，京都，2004年12月13−15日

1. 上久保裕生，村崎康浩，川崎政人，加藤龍一，中山和久，若槻壮市，片岡幹雄
   Ｘ線溶液散乱測定によるアダプター蛋白質GGA（VHS-GAT）の溶液構造の解析
2. 村崎康浩，上久保裕生，川崎政人，加藤龍一，中山和久，若槻壮市，片岡幹雄
   GGA蛋白質2量体形成のおけるVHSドメインの関与
3. 守田真，福角勇人，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   青色光受容タンパク質AppAのPpsRとの相互作用に関わる分光学的特性
4. 笹山裕晃，針貝美樹，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   イエロープロテインにおけるβ5-β6ループの役割
5. 針貝美樹，今元泰，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
   Photoactive yellow proteinにおけるMet100ループの役割
6. 今元泰，片岡幹雄
   マイクロ秒～ミリ秒領域でのイエロープロテインの光反応サイクル
7. 林道弘，上久保裕生，白井久美子，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Ppr（PYP-Phytochrome Related Protein）におけるPYPドメインの役割
8. 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   紅色光合成細菌Rhodobacter capsolatus由来PYPの相互作用分子の探索
9. 福角勇人，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   PpsRの会合状態とDNA結合能に関するPASドメインの役割
10. 對比地久義，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
    紅色光合成細菌Ectothiorhodospira halophila由来NifAのオリゴマー形成に関する研究
11. 藤本知志，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
    光応答性融合蛋白質の設計と創成
12. 鬼塚正義，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
    スタフィロコッカルヌクレアーゼの非天然構造における基質認識機構
13. 白井久美子，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
    Photoactive yellow proteinにおける配列情報の理解の試み
14. 徳久淳師，城地保昌，上久保裕生，中川洋，北尾彰朗，片岡幹雄
    分子動力学計算を用いた活性部位の動的性質の解明

8th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation, Egret Himeji, Himeji, Japan, 2004年9月7−11日

1. H. Kamikubo, N. Shimizu, M. Harigai, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Structural characterization of the M intermediate of Photoactive yellow protein using solution x-ray scattering

11th International Conference on Retinal Proteins, Frauenchiemsee, Germany, 2004年6月20−24日

1. M. Harigai, Y. Imamoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Role of amino acid residues in Met100 loop of photoactive yellow protein
2. Y. Imamoto, M. Harigai, H. Kamikubo, Y.Yamazaki, M.Kataoka
   Secondary structural change of photoactive yellow protein
3. T.Oka, K. Inoue, N. Yagi, M. Kataoka
   Structural kinetics of bacteriorhodopsin by X-ray diffraction of purple membrane with 5 microsecond time resolution

The 1st Pacific-Rim International Conference on Protein Science, The 4th Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan, Pacifico Yokohama, Yokohama, Japan, 2004年4月14−18日

1. H. Tsuihiji, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   The isolation and characterization of transcriptional activator NifA from photosynthetic bacteria, Ectothiorhodospira halophila
2. M. Onitsuka, H. kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Substrate-induced folding of Staphylococcal nuclease

2003年

2nd International Conference on Biomedical Spectroscopy, King's College London, UK, 2003年7月6日

1. Y. Imamoto
   Studies of Structural Change of Photoreceptor Proteins Using Fourier Transform Infrared Spectroscopy

2003年日本蛋白質科学会第3回年会，札幌コンベンションセンター，札幌，2003年6月23−25日

1. 白井久美子，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   単純化されたアミノ酸配列を持つイエロープロテインの物性
2. 片岡幹雄，中川洋，初田竜也，山崎洋一，上久保裕生
   Staphylococcal nuclease のヘリックス領域への系統的アラニン挿入の影響

日本物理学会第58回年次大会，東北大学川内キャンパス・東北学院大学土樋キャンパス，仙台，2003年 3月28−31日

1. 上久保裕生，清水伸隆，針貝美樹，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   X線溶液散乱測定法を用いたPhotoactive Yellow Proteinの光による構造変化の解析
2. 清水伸隆，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
   イエロープロテインのL中間体で生じる水分子の変化
3. 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
   非干渉性中性子弾性散乱による蛋白質動力学の研究

2002年

2002年第40回生物物理学会年会，名古屋大学東山キャンパス，名古屋，2002年11月2−4日

1. 今元泰，針貝美樹，上久保裕生，清水伸隆，片岡幹雄
   イエロープロテインの光による構造変化－I
2. 上久保裕生，清水伸隆，針貝美樹，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   イエロープロテインの光による構造変化－II
3. 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   C末端His-tag PYPを用いたPYPの相互作用の解析
4. 清水伸隆，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
   イエロープロテインの光反応中での発色団のpKa制御メカニズム
5. 平野聡，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal nucleaseの構造形成に果たす140Trpの役割 」
6. 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
   非干渉性中性子弾性散乱による蛋白質の動力学転移の研究
7. 平岡聡，上久保裕生，中川洋，平野聡，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal NucleaseのΩループ改変による機能及び構造安定性の評価
8. 白井久美子，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive yellow proteinのアミノ酸配列の単純化の試み
9. 龍見さなえ，清水伸隆，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive Yellow Proteinにおける グリシンの役割
10. 久保田進、上久保裕生、山崎洋一、今元泰、片岡幹雄
    非天然構造Staphylococcal nucleaseの疎水性相互作用増加による構造形成及び構造安定化
11. 安田玲里、清水伸隆、山崎洋一、上久保裕生、今元泰、片岡幹雄
    アラニン置換を利用したPhotoactive Yellow Proteinの構造形成及び機能発現機構の研究

10th International Conference on Retinal Proteins, University of Washington, Seattle, USA, 2002年8月20−24日

1. M. Kataoka, H. Kamikubo
   Structure and Properties of Photointermediate and Relationship to the Photoreaction（招待講演）
2. Y. Imamoto, H. Kamikubo, M. Harigai, N. Shimizu, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Direct Observation of Light-Induced Global Conformational Change of Photoactive Yellow Protein
3. Y. Imamoto, C. Tamura, H. Kamikubo, M. Kataoka
   Self-Association of Bovine Visual Arrestin as Revealed by Small Angle X-Ray Scattering
4. Y. Yamazaki, T. Nagata, A. Terakita, H. Kandori, Y. Shichida
   Rhodopsin Structural Changes in Early and Late States of Photolysis Detected by Vibrational Changes of Cysteine
5. N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Imamoto, Y. Yamazaki, K. Mihara, M. Kataoka
   Crystal Structure of R52Q Mutant of Photoactive Yellow Protein

224th American Chemical Society National Meeting, Boston, MA, 2002年8月18−22日

1. M. Kataoka
   Inelastic and quasielastic neutron scattering studies on protein dynamics（招待講演）
2. H. Nakagawa, H. Kamikubo, J. C. Smith, M. Kataoka
   Difference of dynamics between folded and unfolded protein studied by elastic incoherent neutron scattering

First International Conference on Biomedical Spectroscopy, Cardiff, Wales, UK, 2002年7月7−10日

1. M. Kataoka
   Neutron Inelastic Scattering as a Hig-Resolution Vibrational Spectroscopy: New Tool for the Study of Protein Dynamics（招待講演）
2. E. Mano, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
   Comparison of the photochemical reaction of PYP in crystal and aqueous solution

1st Asian Conference on Photobiology, Awaji Yumebutai International Conference Center, Hyogo, Japan, 2002年6月26−28日

1. Y. Imamoto, M. Harigai, N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
   Structure and Photoreaction of Photoactive Yellow Protein (Invited Lecture)
2. H. Kamikubo, M. Kataoka
   Relationship between crystal structure and low-resolution structure of photointermediates（招待講演）
3. N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Imamoto, Y. Yamazaki, K. Mihara, M. Kataoka
   Crystal Structures of E46Q and R52Q Mutants of Photoactive Yellow Protein

第2回日本蛋白質科学会年会，名古屋国際会議場，名古屋，2002年 6月13−15日

1. 平野聡，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal nucleaseの140Trp近傍相互作用のシステイン架橋による置き換え
2. 白井久美子，山崎洋一，上久保祐生，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive yellow protein (PYP) のアミノ酸配列の単純化の試み

2001年

4th International Conference on Biological Physics 2001，京都国際会館，京都，2001年月7日30日−8月3日

1. Y. Imamoto, T. Asahi, H. Masuhara, F. Tokunaga, T. Kinoshita, K. Yoshihara, M. Kataoka
   Photochemical event of photoactive yellow protein
2. N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Imamoto, K. Mihara, M. Kataoka
   Elucidation of molecolar recognition mechanism of photoactive yellow protein using ionic molecoles
3. S. Hirano, K. Mihara, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
   The structural role of C-terminal region of Staphylococcal nuclease
4. H. Nakagawa, H. Kamikubo, I. Tukushi, T. Kanaya, M. Kataoka
   The origin of non-gaussianity in q dependence of incoherent elastic neutron scattering

2001年第39回生物物理学会年会，大阪大学，吹田，2001年10月6−8日

1. 今元泰，徳永史生，朝日剛，増原宏，片岡幹雄
   イエロープロテインの光反応初期過程
2. 上久保裕生，清水伸隆，山本泰輝，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive yellow proteinのM中間体崩壊過程の律速段階
3. 山崎　洋一，上久保　裕生，今元泰，片岡　幹雄
   Photoactive yellow proteinの相互作用分子の探索
4. 平野聡，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   システイン架橋導入によるStaphylococcal nucleaseの構造安定化の試み
5. 中川洋，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal nucleaseの非天然状態にみられる基質認識や折り畳みの本質的情報
6. 對比地久義，山崎洋一，片岡幹雄
   Ectothiorhodospira halophilaにおける光合成的水素発生機構の解明
7. 針貝美樹，清水伸隆，安田早苗，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   N末端欠損PYPの構造と光反応

第1回日本蛋白質科学会年会，大阪大学，吹田，2001年6月1−3日

1. 片岡幹雄，大石真市，清水伸隆，安田早苗，小林志麻子，三原憲一，今元泰
   イェロープロテインの光反応は部分的な折畳み反応である
2. 今元泰，田村千恵，上久保裕生，片岡幹雄
   ウシアレスチンの多量体形成の解析
3. 清水伸隆，上久保裕生，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
   モデル低分子を用いたPhotoactive yellow proteinの分子認識機構の解明
4. 平野聡，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal Nucleaseの構造保持におけるC末端の役割
5. 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
   中性子非干渉性弾性散乱のq依存性における非ガウス性の起源

日本物理学会　第56回年次大会，中央大学多摩キャンパス，東京，2001年3月27−30日

1. 清水伸隆，上久保裕生，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
   中間体の構造安定によるPhotoactive yellow proteinの光反応の変化
2. 平野聡，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal Nucleaseの構造保持におけるC末端の役割
3. 中川洋，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   挿入変異体を用いたStaphylococcal nucleaseの非天然状態の研究
4. 安田早苗，三原憲一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive Yellow Proteinの機能に対する C末端部位の役割
5. 針貝美樹，安田早苗，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   N末端欠損PYPの構造と光反応

2000年

9th International Conference on Retinal Proteins, Szeged, Hungary, 2000年9月14-19日

1. M. Kataoka
   Structure and photoreaction of photoactive yellow protein (PYP)　(Invited Lecture)
2. Y. Imamoto, K. Mihara, M. Kataoka
   Chromophore/protein interaction in the photocycle intermediate of photoactive yellow protein
3. S. Yasuda, K. Mihira, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
   The Role of C-terminal Residues on the Function of Photoactive Yellow Protein

2000年第38回生物物理学会年会，東北大学川内キャンパス，仙台，2000年9月11−13日

1. 今元泰，三原憲一，片岡幹雄
   イエロープロテインのM中間体での発色団／蛋白質相互作用
2. 三原憲一，今元泰，徳永史生，片岡幹雄
   イェロープロテインの相互作用パートナーの同定
3. 清水伸隆，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   PYPのM中間体の静電的性質に対するArg52の寄与
4. 平野聡，三原憲一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   C末端欠損がStaphylococcal Nucleaseの構造に与える効果
5. 田村千恵，今元泰，上久保裕生，片岡幹雄
   Ｘ線溶液散乱法によるアレスチン会合状態の解析
6. 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
   中性子非干渉性弾性散乱によるStaphylococcal nucleaseのガラス転移の研究
7. 安田早苗，原憲一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   Photoactive Yellow Proteinの機能へのC末端部位の役割

日本物理学会　2000年春の分科会，関西大学，吹田，2000年3月22−25日

1. 清水伸隆，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   PYPのM中間体で生じる静電的性質の変化
2. 平野聡，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   Staphylococcal NucleaseのC末欠損が構造に与える効果
3. 田村千恵，今元泰，上久保裕生，片岡幹雄
   X線溶液散乱法によるアレスチン会合状態の解析
4. 中川洋，上久保裕生，平野聡，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
   非干渉性中性子弾性散乱によるStaphylococcal Nucleaseの水和依存的なダイナミックスと動的不均一性

1999年

1999年第37回生物物理学会年会，和光市市民文化センター，和光，1999年10月2-5日

1. 今元泰，三原憲一，片岡幹雄
   水溶液試料を用いた赤外分光法によるイエロープロテインの光反応の解析
2. 三原憲一，今元泰，徳永史生，片岡幹雄
   光依存的にPYPと相互作用する蛋白質
3. 上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
   バクテリオロドプシンのDark-Nに見られる高次構造変化
4. 岡俊彦，八木直人，藤沢哲郎，徳永史生，片岡幹雄
   時分割X線回折測定によるバクテリオロドプシンの光反応過程でのM型構造からN型構造への転移
5. 濱田格雄，三原憲一，今元泰，徳永史生，片岡幹雄
   PYPにおけるN末端領域の役割
6. 大石真市，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   PYPの安定性と光の効果
7. 小林志麻子，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   アラニン置換変異によるPYPの構造、機能の評価
8. 清水伸隆，上久保裕生，濱田格雄，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
   暗状態PYP及びPYPMの溶質分子との静電相互作用
9. 平野聡，三原憲一，上久保裕生，片岡幹雄
   C末欠損がStaphylococcal Nucleaseの構造に与える効果