研究業績（学会発表）

論文・著書等 | 学会発表 | 受賞・報道

| 2023 | 2022 | 2021 | 2020 | 2019 | 2018 | 2017 | 2016 | 2015 | 2014 | 2013 | 2012 | 2011 | 2010 | 2009 | 2008 | 2007 | 2006 | 2005 | 2004 | 2003 | 2002 | 2001 | 2000 | 1999

2023

PPF2023 第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
2023年8月31日

• 遠藤伸幸
  >PRMT1による基質EWSメチル化機構の構造生物研究

26TH CONGRESS AND GENERAL ASSEMBLY OF THE INTERNATIONAL UNION OF CRYSTALLOGRAPHY
2023年8月23日-29日

• 藤間 祥子
  >Structural study of self-assembly of PRMT1 and PRMT8 and their implication for biological function

第２３回日本蛋白質科学会年会
2023年7月5日

• K. Yonezawa, K. kimura, T. Sato, Y. Yamazaki, S. toma, H. Kamikubo
  >延伸乾燥したフィブロインナノファイバーゲルの構造評価

第２３回日本蛋白質科学会年会
2023年7月5日

• H. Kajimoto, k. yonezawa, Kok sim Chan, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma, H. Kamikubo
  >異種フィブロイン混合系におけるナノファイバー／前駆体形成評価

The Plant Cell webinar on RNA Biology
2023年6月14日

• 藤間 祥子
  Structural insight into the activation of an Arabidopsis organellar C-to-U RNA editing enzyme by active site complementation.

日本薬学会143年会 (2022年)
2023年3月24日

• 藤間 祥子
  脳上衣腫原因融合タンパク質ZFTA-RelAの核内輸送機構の構造生物研究

2022

日本結晶学会年会
2022年11月26日-11月27日

• 藤間 祥子
  脳上衣腫原因融合タンパク質ZFTA-RelAの核内輸送機構の構造研究

第95回日本生化学大会
2022年11月9日-11月11日

• 藤間 祥子
  コファクター結合が制御するPRMT1自己集合機構の構造科学研究

AsCA2022
2022年10月30日-11月2日

• 藤間 祥子
  Structural study of self-assembly mechanism of hPRMT1 regulated by the methylation cofactors.

蛋白研セミナー Frontier of Dynamic Structural Biology(構造生物学と計算科学の融合による動的構造生物学の新しい展開)
2022年10月17日

• 藤間 祥子
  Structural insight into the nuclear transportation of ependymoma-driving ZFTA-RELA fusion Protein

第60回日本生物物理学会,函館アリーナ・函館市民会館, 2022年9月28-30日

• Y. Yamazaki, Y. Narahara, H. Kamikubo
  RcPYP と PBP 相互作用における表面電荷の効果
• K. Yonezawa,Y. Yamazaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  Photoactive Yellow Protein における酸性アミノ酸に置換した 52 番目の残基のプロトン化状態
• Kok Sim Chan, K. Yonezawa, H. Kajimoto, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  Isolation and characterization of a 200kDa fibroin precursor
• H. Kajimoto, K. Yonezawa, Kok Sim Chan, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  異種フィブロイン混合系におけるナノファイバー/前駆体形成評価
• R. Aiba, K. Yonezawa, Y. Okamoto, H. Kajimoto, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  クモ糸タンパク質フィブロインのナノファイバーの単位構造の解明
• K. Iwasaki, K. Yonezawa, S. Onishi, M. Daidai, H. Kajimoto, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  剪断応力がフィブロインナノファイバーに及ぼす影響
• K. Kimura, K. Yonezawa, Y. Nakatani, S. Onishi, H. Kajimoto, T. Sato,Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  フィブロインナノファイバーの違いによる延伸乾燥ハイドロゲルの特性の比較
• D. Takenaka, Y. Yamazaki, K. Yonezawa, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  RcPYP と PBP の複合体形成に及ぼす PBP C 末端部位の役割 
• R. Tani, Y. Yamazaki, K. Yonezawa, S. Toma, H. Kamikubo
  レジリン蛋白質における自己組織化能の評価
• M. Takasugi, Y. Yamazaki, K. Yonezawa, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo1
  光受容タンパク質を用いた液液相分離の光制御システムの作製

第16回バイオ関連化学シンポジウム,名古屋大学, 2022年9月10-12日

• 藤原 綱大,大西 遥喜,真島　剛史,小林　直也,山中 優,米澤　健人,上久保　裕生,内橋 貴之,廣田　俊
  循環置換とαへリックス挿入を用いた３ユニット環状ヘムタンパク質の構築と構造解析

第48回生体分子科学討論会,鳥取市とりぎん文化会館, 2022年6月30-7月1日

• 藤原　綱大,大西　遥喜,真島　剛史,小林　直也,山中　優,米澤　健人,上久保　裕生,内橋　貴之,廣田　俊
  αヘリックスで連結した3ユニット環状ヘムタンパク質の構築と構造解析
• 中村伊武輝,雨坂　心人,米澤　健人,上久保　裕生,田中 俊一,廣田　俊,松尾　貴史
  抗体ミメティックタンパク質「モノボディ」を用いた構造変化トラップによる酵素活性制御法の開発

第22回日本蛋白質科学会年会,つくば国際会議場, 2022年6月7-9日

• 米澤健人，山崎洋一，片岡幹雄，上久保裕生
  Photoactive Yellow Protein における 52 位を酸性アミノ酸残基に置換した時のプロトン化状態
  Protonation state of 52nd position replaced to an acidic amino acid residue in Photoactive Yellow Protein
• Kok Sim Chan，米澤健人，佐藤健大，山崎洋一，藤間祥子，上久保裕生
  The Effect of Molecular Weight on the Formation of Fibroin Precursor and Nanofiber
• 梶本遥也，饗庭楽理，岡本悠介，米澤健人，佐藤健大，山崎洋一，藤間祥子，上久保裕生
  クモ糸フィブロインからなるナノファイバー構造の解明
  Nanofiber Structure Composed of Spider Silk Fibroin

日本薬学会第142年会,オンライン開催, 2022年3月25-28日

• 藤間祥子
PPARg核内輸送機構の構造生物学的研究

日本化学会第102春季年会,オンライン開催, 2022年3月23-26日

• 中村　伊武輝,雨坂　心人,米澤　健人,上久保　裕生,田中　俊一,松尾　貴史
抗体タンパク質を用いた構造変化トラップによるアデニル酸キナーゼの活性制御
• 藤原　綱大,大西　遥喜,真島　剛史,小林　直也,山中　優,米澤　健人，上久保　裕生，内橋　貴之，廣田　俊
αヘリックスで連結した3ユニット環状ヘムタンパク質の溶液構造の評価

2021年度量子ビームサイエンスフェスタ,オンライン開催, 2022年3月7-9日

• 藤間祥子
植物オルガネラC-to-U RNA編集酵素DYW-1の構造生物研究

2021

International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2021

• M. Kariya, K. Omoto，K. Yasuhara, Y. hayashi, H. Kamikubo, Gwenael Rapenne
  ・Formation of lipid cubic phase by organic-inorganic hybrid lipid

第59回　日本生物物理学会,仙台国際センターオンライン開催,シンポジウム,2021年11月25日～11月27日

• オーガナイザー：秋山　修志, 上久保　裕生
  シンポジウムタイトル：総合的多階層アプローチによるシアノバクテリア生物時計システムの新展開
  ・H. Kamikubo, Y. Yamazaki
  ・"Binding behavior of KaiA for phosphorylated/dephosphorylated KaiC ensemble using continuous titration small-angle X-ray scattering"（招待講演）

第59回　日本生物物理学会,仙台国際センターオンライン開催,2021年11月25日～11月27日

• Kok Sim Chan, K. Yonezawa, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  The Effect of Molecular Weight on the Formation of Fibroin Precursor and Nanofiber
• 米澤 健人 , 林 有吾 , 山崎 洋一 , 清水 伸隆 , 上久保 裕生
  放射光 X 線溶液散乱測定における連続濃度変調型 μ 流路自動サンプリングシステムの性能評価
• 堤 建人 , 大西 悟 , 大代 宗弥 , 米沢 健人 , 佐藤 健大 , 山崎 洋一 , 藤間 祥子 , 上久保 裕生
  フィブロインの剪断応力解析
• 梶本 遥也 , 岡本 悠介 , 米澤 健人 , 佐藤 健大 , 山崎 洋一 , 藤間 祥子 , 上久保 裕生
  クモ糸フィブロインからなるナノファイバー構造の解明
• Suhyang Kim, Y. Nakasone, A. Takakado, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Terazima
  Intermolecular interaction dynamics between PYPs and downstream PYP-binding proteins
• 楢原 陽子 , 山崎 洋一 , 米澤 健人 , 藤間 祥子 , 上久保 裕生
  RcPYP の複合体形成反応に対する塩濃度効果
• 大久保 海 , 山崎 洋一 , 米澤 健人 , 藤間 祥子 , 上久保 裕生 　　
  発色団水素結合を欠損した桂皮酸導入 RcPYP の光反応・相互作用
　　

第94回日本生化学会大会,2021年11月5日

• 藤間 祥子
  多様な基質認識機構を有する蛋白質アルギニンメチル基転移酵素の構造研究

第5回LLPS研究会,オンライン,2021年9月9日

• 藤間 祥子
  LLPS制御因子蛋白質アルギニンメチル基転移酵素(PRMT1)の構造生物研究

第21回日本蛋白質科学会年会,オンライン,2021年6月16-18日

• 高瀬 安迪、山崎 洋一、林 有吾、 米澤 健人、藤間 祥子、上久保 裕生
  TIM バレルファミリーにおける構造エレメントの分子進化学的考察

• 米澤 健人、林 有吾、吉田 桂人、 天野 真治、岡部 龍二、清水 伸隆、 上久保 裕生
  放射光 X 線溶液散乱測定における連続濃度変調型μ流路自動サンプリングシステムの性能評価

2020

第33回放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム,ウインクあいち(愛知県名古屋市),2020年1月11日

• 米澤健人, 林有吾, 吉田桂人, 天野真治, 岡部龍二, 清水伸隆, 上久保裕生
  連続滴定 X 線溶液散乱測定を利用した分子複合系における多成分平衡状態の解析

第43回 日本分子生物学会年会,2020年12月3日

• 藤間 祥子
  液-液相分離制御因子として働く蛋白質アルギニンメチル化酵素(PRMT1)の構造生物研究

日本結晶学会年会,2020年11月27日

• 藤間祥子,端山浩輝,松浦 滉明,坂井直樹,平田邦生,松谷優輝,清水光,大畑慎也,林有吾,山崎洋一,堅田利明,清水敏之,上久保裕生
  強度クラスタリング法を利用した蛋白質複合体の結晶内構造多型の同定

2019

AsCA2019,2019年12月17-20日

• S. Toma-Fukai, H. Shimizu, K. Kontani, T. Katada, T. Shimizu
  Structural study of SmgGDS reveals unique nucleotide exchange mechanism for RhoA

第42回日本分子生物学会年会,マリンメッセ福岡(福岡県福岡市),2019年12月2-6日

• 上久保裕生
  構造タンパク質フィブロインのタンパク質から材料への質的変化

AsCA2019,2019年12月17-20日

• S. Toma-Fukai, R. Hibi, M. Sakai, T. Naganuma, S. Saijo, N. Shimizu, M. Matsumoto, and T. Shimizu
  Crystal structure of PCAF homology domain of GCN5 reveals its unique structure as ubiquitin E3 ligase

nternational Symposium on Diffraction Structural Biology 2019,2019年10月17-20日

• S. Toma-Fukai, R. Hibi, M. Sakai, T. Naganuma, S. Saijo, N. Shimizu, M. Matsumoto, and T. Shimizu
  Crystal structure of PCAF homology domain of GCN5 reveals its unique structure as ubiquitin E3 ligase

第57回日本生物物理学会年会,宮崎シーガイヤコンベンションセンター(宮崎市), 2019年9月24-26日

• H. Kamikubo, T. Sato
  Artificial reconstitution of the multi-hierarchical structure in spider silk from fibroin proteins
• Y. Yamazaki, N. Oka, Y. Hayashi, H. Kamikubo
  Functional role of a residue K72 of Rc-PYP in light dependent oligomeric complex formation process
• R. Aoyama, Y. Yamazaki, K. Yonezawa, A. Mukaiyama, Y. Hayashi, S. Toma-Fukai, N. Shimizu, S. Akiyama, H. Kamikubo
  Titration analysis of KaiA for KaiC using continuous titration small angle X-ray scattering
• Y. Takase, Y. Hayashi, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  Molecular evolution of the structure elements in the TIM barrel family proteins
• T. Sawai, K. Hayashi, Y. Hayashi, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  Mechanism of the spontaneous elongation of the fibroin nanofiber involved in spider silk.
• S. Onishi, Y. Nakatani, Y. Hayashi, T. Sato, Y. Yamazaki, S. Toma-Fukai, H. Kamikubo
  Reconstitution of artificial materials of spider silk accompanied by native-like hierarchical structure.
• Y. Hayashi, N. Endo, Y. Yamazaki, S. F. Toma, H. Kamikubo
  Analysis of the complex molecular system composed of GGA, MPR and Ub by using titration SAXS measurement

13th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation, ShanghaiTech University(China, Shanghai), 2019年9月21-24日

• K. Yonezawa, M. Takahashi, K. Yatabe, Y. Nagatani, Y. Hayashi, S. Amano, H. Kamikubo, N. Shimizu
  Recent Progress of BioSAXS Equipment for Complex Molecular Systems at the Photon Factory

Satellite meeting for PF Workshop:Marriage of Computational and Experimental Techniques for Solution Small-angle Scattering,京都大学複合原子力科学研究所(大阪府泉南郡熊取町), 2019年9月13日

• 米澤健人, 清水伸隆, 上久保裕生
  Recent Approaches to Serial Data Analysis of BioSAXS at the Photon Factory

第92回日本生化学会大会,横浜市, 2019年9月19日

• 藤間祥子
  蛋白質アルギニンメチル化酵素(PRMT1)の自己集合が担う活性制御機構の構造

ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」,東京大学物性研究所(柏市), 2019年9月5-6日

• 山崎洋一
  水溶性光受容体PYPの光化学反応と相互作用

第34回奈良先端大産学連携フォーラム,関西経済連合会中之島ｾﾝﾀｰﾋﾞﾙ(大坂市), 2019年7月26日

• 上久保裕生
  タンパク質分子複合系の特性と材料科学への展開

第19回日本蛋白質科学会年会,神戸国際会議場(兵庫県神戸市), 2019年6月24-26日

• 高瀬 安迪, 林 有吾, 山崎 洋一,上久保 裕生
  TIM バレル蛋白質ファミリーにおける構造エレメントの分子進化
  Molecular evolution of the structure elements in the TIM barrel family proteins

2018

2018年度　量子ビームサイエンスフェスタ,エポカルつくば(茨城県つくば市),2019年3月12-13日

• 米澤健人, 清水伸隆, 上久保裕生
  Photon Factoryにおける連続滴定X線溶液散乱測定を用いた蛋白質複合体の測定・解析環境の構築

神戸大学先端融合研究環自然科学・生命医学系融合研究領域
研究プロジェクト「非共有結合系分子科学研究」ワークショップ,神戸大学(兵庫県神戸市),2019年1月22-23日

• 上久保裕生
  弱い相互作用で関連付けられた分子複合系の溶液構造・相互作用解析

PF研究会「多様な物質・生命科学研究に広がる小角散乱〜 多（他）分野の小角散乱を学ぼう！」,高エネルギー加速器研究機構(茨城県つくば市),2018年12月20-21日

• 米澤健人, 清水伸隆, 上久保裕生
  Photon Factoryにおける連続滴定X線溶液散乱測定を用いた蛋白質複合体の測定・解析環境の構築

第41回日本分子生物学会年会,パシフィコ横浜(神奈川県横浜市),2018年11月28-30日

• 上久保裕生
  マルチドメイン蛋白質をプラットフォームとした蛋白質複合系の相互作用・構造解析

第56回日本生物物理学会年会,岡山大学(岡山県岡山市), 2018年9月15-17日

• H. Kamikubo
  Structural analysis of multiple-component systems using continuous titration SAXS
• Y. Takase, Y. Hayashi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo
  Structure elements are building blocks of protein tertiary structure responsible for protein stability
• Y. Hayashi, N. Endo, Y. Yamazaki, K. Nakayama, S. Wakatsuki, H. Kamikubo
  Structure and interaction analysis of GGA by using titration SAXS measurement
• S. Amano, Y. Hayashi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo
  Improvement of the micro-fluidics based auto sampling system designed for continuous titration experiments.
• N. Oka, Y. Yamazaki, Y. Hayashi, H. Kamikubo
  Elucidation of the complex formation process using Rc-PYP mutant K72Q

第18回日本蛋白質科学会年会,(新潟県新潟市), 2018年6月26-28日

• 高瀬安迪, 林有吾, 山崎洋一, 上久保裕生
  残基間コンタクトの定量化による構造エレメントの予測(ポスター賞受賞)

2017

日本化学会第98春季年会,日本大学理工学部(千葉県船橋市), 2018年3月20-23日

• 上久保裕生
  光による蛋白質分子複合系の自由エネルギーランドスケープの変調(特別企画講演)

The 6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions,静岡県浜松市, 2018年1月20-21日

• H. Kamikubo
  Structural Exploring Multi-component Equilibrium in Biological Systems by using Continuous Titration SAXS
• S. Nakata, K. Baba, Y. Hayashi, Y. Yamazaki, N. Inagaki, H. Kamikubo
  Multiple phosphorylation and structural alteration of shootin1
• E. Natsumi, Y. Hayashi, M. Shinohara, K. Yoshida, Y. Yamazaki, H. Kamikubo
  Structure and interaction analysis of the complex molecular systems (GGA/Arf/MPR/Ub) involved in Clathrin-coated vesicles

第4回タンパク質X線溶液散乱講習会, 高エネルギー加速器研究機構(茨城県つくば市), 2017年12月12-13日

• 上久保裕生
  講義「投稿規定(2017改訂版)に関して」「連続滴定溶液散乱による多成分系解析の標準化」(招待講演)

日本学術振興会 構造生物第169委員会 第54回研究会,東京大学大学院 農学生命科学研究科 中島薫一郎記念ホール(東京都文京区), 2017年11月29日

• 上久保裕生
  混合溶液中の蛋白質分子複合系の構造・相互作用評価～デバイス開発とその応用～(招待講演)
　　

第40回溶液化学シンポジウム, イーグレ姫路(兵庫県姫路市), 2017年10月19日

• 上久保裕生
  連続滴定溶液散乱測定による蛋白質分子複合系の多成分平衡状態の解析(招待講演)
　　

分子・物質合成プラットフォーム、大学連携研究設備ネットワーク主催
「ソフトでウェットな素材のやさしい観察」, 東京国際交流館(東京都江東区), 2017年10月6日

• 上久保裕生
  複数混合溶液中に存在する生体高分子の構造・相互作用評価(招待講演)
　　

第55回日本生物物理学会年会,熊本大学(熊本県熊本市), 2017年9月19-21日

• Y. Yamazaki, Y. Shibata, Y. Hayashi, N. Endo, K. Ishii, S. Uchiyama, T. Uchihashi, H. Kamikubo
  Light dependent multiple complex formation of Rc-PYP
• Y. Hayashi, T. Murakami, M. Arakawa, K. Yoshida, Y. Yamazaki, T. K. Sato, H. Kamikubo
  Self-assembly of nanofibers from spider silk fibroin
• Y. Takase, Y. Hayashi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo
  Structure elements are closely related to intramolecular residue-residue contacts
• J. S. Sum, Y. Yamazaki, Y. Hayashi, H. Kamikubo
  Influence of the PYP domain on Photoreaction of the phytochrome domain in Ppr
• S. Nakata, K. Baba, Y. Hayashi, Y. Yamazaki, N. Inagaki, H. Kamikubo
  Multiple phosphorylated species of shootin1 and their solution structure

The 24th Congress & General Assembly of the International Union of Crystallography, Hyderabad International Convention Centre, Hyderbad, India, 2017年8月21-28日

• H. Kamikubo
  Structural Exploring Multicomponent Equilibrium in Biological Systems(招待講演)
　　

第17回日本蛋白質科学会, 仙台国際センター(宮城県仙台市), 2017年6月20-22日

• 上久保裕生, 山崎 洋一
  複数の蛋白質複合体を含む多成分系平衡状態の構造解析
  Structure-based analysis on the equilibrium state of a multi-component system
• Jia-Siang Sum, 山崎 洋一, 林 有吾, 上久保 裕生
  Photoproducts of PYP Phytochrome Related (Ppr) protein accumulated under various illumination conditions
　　

新学術領域研究「動的秩序と機能」全体班会議, 沖縄科学技術大学院大学(沖縄県恩納村), 2017年6月2-5日

• 上久保裕生
  機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査
　　

Frontier Bioorganization Forum 2017 Dynamical ordering and ​integrated functions of ​biomolecular systems, Taipei,Taiwam, 2017年4月24-26日

• H. Kamikubo
  Multi-component equilibrium in biological systems explored by using continuous titration SAXS(招待講演)

2016

第78回岡崎コンファレンス Grand Challenges in Small-angle Scattering, 愛知県岡崎市, 2017年3月18-20日

• H. Kamikubo
  Structural Exploring Multi-component Equilibrium in Biological Systems by using Continuous Titration SAXS(招待講演)

The 5th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions,東京都目黒区, 2017年1月21-22日

• Y. Shibata, Y. Yamazaki, K. Yoshida, S. Nakata, H. Kamikubo
  Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module
• S. Nakata, Y. Hayashi, K. Baba, K. Yoshida, Y. Shibata, Y. Yamazaki, N. Inagaki, H. Kamikubo
  Structural change of shootin1 upon phosphorylation revealed by using small angle x-ray scattering
• C. Ota, Y. Yakase, K. Ishii, T. Aizawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka, S. Uchiyama, H. Kamikubo
  Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin by chimera calcitonin
• E. Natsumi, Y. Hayashi, M. Shinohara, K. Yoshida, Y. Yakazaki, H. Kamikubo
  An analysis of the interaction of GGA with ubiquitin by using titration SAXS measurement

第54回日本生物物理学会年会,茨城県つくば市, 2016年11月25-27日

• Y. Yamazaki, Y. Shibata, H. Kamikubo
  Complex induced structural changes of Rhodobacter capsulatus Photoactive Yellow Protein
• Y. Shibata, Y. Yamazaki, K. Yoshida, S. Nakata, H. Kamikubo
  Analysis of light dependent multiple complex formation of Rc-PYP
• C. Ota, H. Tanaka, T. Aizawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin by chimera calcitonin
• Y. Hayashi, M. Shinohara, K. Yoshida, Y. Yamazaki, K. Nakayama, S. Wakatsuki, H. Kamkubo
  An analysis of the interaction of GGA with ubiquitin by using titration SAXS measurement
• S. Nakata, K. Yoshida, K. Baba, Y. Shibata, Y. Yamazaki, N. Inagaki, H. Kamikubo
  Structural alteration of shootin1 upon phosphorylation revealed by using small angle x-ray scattering

The 9th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences, Gyeongju, Korea, 2016年11月16日

• Hironari Kamikubo
  Dynamical characterization of a denaturant denatured state by using the lifetime measurement of Trp-triplet state(招待講演)

平成28年度第1回生物構造学研究会, 東京都新宿区, 2016年9月2日

• 上久保裕生
  システムズバイオロジーを指向した構造生物学的手法の開発(招待講演)
  webページはこちら

新学術領域研究「動的秩序と機能」全体班会議, 滋賀県長浜市, 2016年6月11-13日

• 上久保裕生
  機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査

2015

PF研究会「徹底討論！小角散乱の魅力～基礎・応用・産業利用」, 茨城県つくば市, 2016年3月30日

• 上久保裕生
  蛋白質溶液散乱を用いた多成分平衡状態の構造/相互作用解析の試み

2015年度量子ビームサイエンスフェスタ, 茨城県つくば市, 2016年3月15日

• 米澤　健人
  Photoactive Yellow Proteinにおけるアルギニン52の精密構造解析

The Biophycial Society 60th Annual Meeting, Los Angeles, California, USA, February 27-March 2, 2016

• Hironari Kamikubo, Keito Yoshida, Nobutaka Shimizu, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  Development of auto-sampling system designed for titration-saxs to investigate protein complexes under an equilibrium condition
• Chiaki Ota, Hiroko Tanaka, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka Hironari Kamikubo
  Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin

The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015,Honolulu, Hawaii, USA, December 15-20, 2015

• Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  Mechanism of amyloid formation of human calcitonin
• Phillip Anfinrud, Friedrich Schotte, Hyun Sun Cho, John Kyndt, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  Picosecond photobiology: Watching a signaling protein function in real time via 150-picosecond time-resolved X-ray diffraction and solution scattering
• Hikaru Kuramochi, Satoshi Takeuchi, Kento Yonezawa, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Tahei Tahara
  Femtosecond time-resolved impulusive stimulated Raman study of the primary process of photoactive yellow protein

新学術領域研究「動的秩序と機能」第4回国際シンポジウム,福岡県福岡市, 2015年11月22－23日

• H. Kamikubo
  Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module
• J. Makino, K. Yoshida, Y. Kubo, K. Baba, Y. Yamazaki, N. Inagaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  Structural investigation of direct interaction between Shootin1 and cortactin by the titration SAXS measurements
• C. Ota, H. Tanaka, T. Aizawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin

第3回タンパク質X線溶液散乱講習会,つくば市, 2015年11月19日

• 上久保裕生
  BioSAX論文投稿規定に関して

新学術領域研究「動的秩序と機能」第２回若手研究会,愛知県蒲郡市, 2015年10月5－7日

• 米澤 健人
  Photoactive Yellow Proteinにおけるアルギニン52のプロトン化状態
• 吉田 桂人
  PYP - Phytochrome Related Proteinの発色団が構造へ与える影響
• 篠原 美帆
  滴定X線溶液散乱測定によるアダプター蛋白質GGA-ユビキチン複合体の相互作用/構造解析

第64回高分子討論会,仙台市, 2015年9月15－17日

• 上久保裕生
  水－蛋白質界面の電荷状態と蛋白質内部で生じる化学反応

第53回日本生物物理学会年会,金沢市, 2015年9月13－15日

• H. Kamikubo
  Structural characterization of a denaturant denatured state
• Y. Yamazaki, A. Kawamura, M. Kataoka, H. Kamikubo
  Analysis of interaction sites on β-scaffold region of Rhodobacter capsulatus Photoactive Yellow Protein
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, Y. Kanematsu, Y. Yamazaki, M. Tachikawa, M. Kataoka
  Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein
• K. Yoshida, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  Effects of chromophores of PYP - Phytochrome Related Protein on the structure
• Y. Konno, Takeshi Inagaki, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  Intramolecular interaction as a determination factor for structure elements of proteins
• M. Shinohara, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
  Interaction/Structure analysis of GGA-Ubiquitin complex by using titration SAXS Measurement
• J. Makino, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka, K. Yoshida, N. Inagaki, Y. Kubo, K. Baba
  Structural investigation of direct interaction between Shootin1 and cortactin by the titration SAXS measurements
• T. Yasumuro, Y. Yamazaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  The role of N-terminal region of PYP binding protein at the formation of complex with Rc-PYP.

第15回日本蛋白質科学会年会,徳島市, 2015年6月24－26日

• 上久保裕生、岡部龍二、吉田佳人、山崎洋一
  滴定溶液散乱測定用自動サンプリングシステムの開発と応用

IMS Asian International Symposium, Supramolecular Dynamics at the Interface of Chemistry and Biology,愛知県岡崎市, 2015年6月12－13日

• H. Kamikubo
  Designing an Artificial Protein by Using a Kind of Building Blocks Responsible for Structure and Function

2014

第３回物構研サイエンスフェスタ, 茨城県つくば市, 2015年3月17－18日

• 上久保裕生
  X線溶液散乱測定用AUTO-SAMPLING装置の開発と応用

The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions, 三重県志摩市, 2015年1月11-12日

• H. Kamikubo, M.Kataoka
  Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Ptotein
• Y. Keito, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Relationship of the photoreactions of two sensor domains in PYP-Phytochrome Related Protein
• H. Tanaka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin
• A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The elucidation of the relationship between b4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs
• S. Aoyagi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Characterization of the denatured structure of staphylococcal nuclease by tryptophan triplet state lifetime measurements

分子システム研究における溶液散乱, 愛知県岡崎市, 2014年12月20日

• 上久保裕生
  溶液散乱の出版ガイドラインについて(招待講演)

The 7th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations, Seoul, Korea, 2014年11月26－28日

• H. Kamikubo
  Molecular actions in the light sensor protein, Photoactive Yellow Protein(招待講演)

16th International Conference on Retinal Proteins, 滋賀県長浜市, 2014年10月5－10日

• M. Kataoka
  Structure and photoreaction of photoactive yellow protein
• Y. Yamazaki, Y. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Analysis for different property of light induced structural changes between two PYPs
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Structural change in Arginine 52 of photoactive yellow protein during the photoreaction
• K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Light-induced structural change of PYP-phytochrome related protein
• A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The elucidation of the relationship between β4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs

第270回 光ナノサイエンス特別講義, 奈良県生駒市, 2014年10月1日

• 上久保裕生
  「機能性を生み出す複雑系分子システムの動作機構と構築」

第1回「動的秩序と機能」若手研究会, 宮城県刈田郡蔵王町, 2014年9月28－30日

• 米澤健人, 上久保裕生, 吉田桂人, 山崎洋一, 片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinにおけるアルギニン52のプロトン化状態
• 青柳貞利, 山口真理子, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄
  トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの変性構造の評価
• 岡部龍二, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄
  マイクロ流路を用いたX線溶液散乱測定サンプルチェンジャーの開発

第52回日本生物物理学会年会, 北海道札幌市, 2014年9月25－27日

• H. Kamikubo
  Molecular actions of the light sensor protein, Photoactive Yellow Protein, as a prototype for sensor proteins
• Y. Yamazaki, Y. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Analysis for different property of light induced structural changes between two PYPs
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein
• K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Relationship of the photoreactions between two sensor domains in PYP-Phytochrome Related Protein
• R. Okabe, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Development of a microfluidics-based auto-sample changer for solution X-ray scattering
• H. Tanaka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin
• S. Aoyagi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Characterization of the denatured structure of staphylococcal nuclease by tryptophan triplet state lifetime measurements
• A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The elucidation of the relationship between β4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs
• M. Noji, M. Arakawa, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, . Kataoka
  Acid induced proton transfer in Photoactive Yellow Protein

The 14th KIAS Conference on Protein Structure and Function, Seoul Korea, 2014年9月18－20日

• H. Kamikubo, M. Kataoka
  The potential uses of structure and function elements (招待講演)

高エネルギー加速器研究機構「第8回大学生のための素粒子・原子核、物質・生命スクール」サマーチャレンジ2014, 茨城県つくば市, 2014年8月23－24日

• 上久保裕生
  演習「タンパク質の形を見てみよう」
  講義「光散乱・小角散乱に関する基礎」「X線溶液散乱デモデータの処理」

新学術領域研究「動的秩序と機能」班会議, 石川県小松市, 2014年8月4－7日

• 上久保裕生
  機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査

東京理科大学総合研究機構「分子連関相乗系研究部門」セミナー,東京都新宿区, 2014年7月26日

• 上久保裕生
  弱い相互作用で関連づけられたタンパク質分子集団の特性と制御(招待講演）

第14回日本蛋白質科学会年会, 横浜市, 2014年6月25－27日

• 上久保裕生
  マルチドメイン蛋白質におけるドメイン再配置と結合調整
• 山崎洋一、松本寛史、上久保裕生、片岡幹雄
  Rhodobacter capsulatus PYP結晶構造に見られる活性中間体様構造の解析

第2回タンパク質X線溶液散乱講習会, つくば市, 2014年6月3－4日

• 上久保裕生
  BioSAXS論文投稿規定に関して(招待講演）

第47回量子物理化学セミナー兼理数GPセミナー, 横浜市, 2014年6月4日

• 上久保裕生
  共役した蛋白質分子内プロトン移動反応の実験的検証(招待講演）

2013

SPring-8 ワークショップ「SPring-8とユーザーのさらなる連携を目指して」, 兵庫県佐用郡佐用町, 2014年2月1－2日

• 上久保裕生
  溶液散乱を用いた多成分平衡系における構造解析(招待講演）
　　

新学術領域研究「動的秩序と機能」第2回国際シンポジウム, 京都市, 2014年1月11－12日

• H. Kamikubo
  Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module(招待講演)
• Y. Yamazaki, M. Shimada, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Interaction sites analysis for the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsulatus
• M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Local disordered structure of staphylococcal nuclease studied by tryptophan triplet state lifetime measurement
• T. Matsumoto, M. Yamaguchi, R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Loop dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale
• T. Minemura, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Local flexibility around tryptophan140 and its relationship to non-local interaction in disordered staphylococcal nuclease
• T. Morimoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Extraction of function elements from green fluorescent protein
• M. Noji, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Protonation state of R52 at the pypm intermediate state
• H. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus
• Y. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Analysis of Equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins
• E. Ohta, T. Watanabe, T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, T. Hohsaka, M. Kataoka
  Statistical characteristics of unfolded staphylococcal nuclease studied by FRET analysis
• M. Arakawa, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme

Sixth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences:Experiments and Simulations, Okazaki, Japan, 2013年11月25－27日

• H. Kamikubo
  Functional modification of a protein by using element implantaion（招待講演）

GIST-NCTU-NAIST International Joint Symposium 2013, Ikoma, Japan, 2013年11月21－26日

• D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Excited-state proton transfer in fluorescent Photoactive Yellow Protein containing 7-hydroxycoumarin

分子科学研究所研究会：ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る, 岡崎市, 2013年11月18－19日

• 山崎洋一
  PYPの分光学的性質の多様性獲得機構
• 松本芳晃、山崎洋一、上久保裕生、山口真理子、片岡幹雄
  キメラ変異体を用いたPYPの光反応中間体の解析
• 野路将義､上久保裕生、山崎洋一、山口真理子、片岡幹雄
  水溶液中におけるPYP_M中間体のアルギニン52のプロトン化状態

第51回日本生物物理学会年会, 京都市, 2013年10月28－30日

• M. Kataoka, H. Kamikubo, F. Schotte, H. S. Cho, P. Anfinrud
  Time-resolved Laue crystallography of photoactive yellow protein with 150psec time resolution
• M. Deshpande, P. Parui, M. Yamanaka, S.i Nagao, H. Kamikubo, M. Kataoka, H. Komori, Y. Higuchi, S. Hirota
  Domain-Swapped Oligomerization and Molten Globule State of Cytochrome c
• Y. Yamazaki, M. Shimada, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus
• R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Maruyama, J. Yunoki, K. Fukuyama, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity
• D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Exited State Proton Transfer of Fluorescent Photoactive Yellow Protein Reconstituted with Hydroxycoumarin
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein
• K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  X-ray Solution Scattering Studies of PYP-Phytochrome Related Protein
• E. Ohta, T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, T. Watanabe, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
  Analysis of unfolded structure of Staphylococcal nuclease mutants by using FRET
• T. Matsumoto, M. Yamaguchi, R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Main-chain dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale
• T. Minemura, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Local flexibility of denatured structure and its relationship to non-local interaction in staphylococcal nuclease
• T. Morimoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Extraction of Function Elements from Green Fluorescent Protein
• M. Arakawa, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme
• H. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus
• Y. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Analysis of Equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins
• M. Noji, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Protonation state of R52 at the PYP_M intermediate state

生命システムにおける動的秩序形成と高次機能発現 第１回公開シンポジウム, 岡崎市, 2013年10月2日

• 上久保裕生
  機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール)の動的秩序の探査

日本物理学会2013年秋季大会, 徳島市, 2013年9月25－28日

• 松本昇紘，山口真理子，芝るみ，上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
  トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの主鎖の運動性評価

The International Conference on Advanced Materials Science and Technology, Yogyakarta, Indonesia 2013年9月17－18日

• D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Excited-state proton transfer in fluorescent Photoactive Yellow Protein containing 7-hydroxycoumarin

分子・物質合成プラットフォーム技術研修会, 京都市, 2013年8月22日

• 上久保裕生
  X線溶液散乱法を用いたタンパク質構造の解析 (招待講演）

NAIST未来開発コロキウム～明日をつくる分子・人材ネットワーク, 生駒市, 2013年8月9日

• 上久保裕生
  折り畳み機構を踏まえた蛋白質分子設計法の開発 (招待講演)

国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」第2回研究プログラム, 京都市, 2013年8月8日

• 上久保裕生
  光センサー蛋白質からみた階層間の連続性

第3回CIMoSセミナー, 岡崎市, 2013年6月28日

• 上久保裕生
  光センサー蛋白質の局所状態変化と全体構造変化 (招待講演）

第13回日本蛋白質科学会年会，鳥取市， 2013年6月12－14日

• 上久保裕生
  Photoactive Yellow Protein中の低障壁水素結合と近傍アルギニンの解離性 (招待講演）

国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」第1回研究プログラム, 京都市, 2013年4月21日

• 上久保裕生
  弱い相互作用で関連づけられたタンパク質分子集団の構造学的解析

2012

第38回量子物理科学セミナー, 横浜, 2012年12月21日

• 上久保裕生
  結晶構造解析と溶液散乱測定から見た光センサー蛋白質の局所構造と全体構造（招待講演）

The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions（「揺らぎと生体機能」第6回公開シンポジウム）, Kyoto, Japan, 2012年12月5－6日

• R. Shiba, H. Kamikubo, J. Yunoki, K. Fukuyama, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The role of the flexible loop in staphylococcal nuclease on its catalytic activity
• D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Fluorescence properties of chromophore-modified photoactive yellow protein
• E. Ohta, T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, K. Shiraga, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
  The comparison of fluorescent spectra between wild type staphylococcal nuclease and the mutants based on FRET
• N. Kohzuki, H. Kamikubo, T. Aizawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Amyloid fibril inhibition mechanism of human calcitonin
• M. Sakonji, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Extraction of the structure elements from PYP
• M. Shimada, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Analysis of interaction sites on the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsulatus with chimeric proteins
• M. Narumi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Roles of hydrogen bonds around chromophore in photoactive yellow protein studied by OH-deficient cinnamic acid
• K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Structural analysis of PYP-phytochrome related protein during its photoreaction by using small angle X-ray scattering
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, S. Yamaguchi, T. Tamada, K. Kurihara, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Protonation state of arginine 52 near the low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein

第50回日本生物物理学会年会, 名古屋, 2012年9月22－24日

• H. Kamikubo, E. Sakai, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Element-based molecular design can reproduce an artificial protein with an expected enzymatic activity
• Y. Yamazaki, M. Shimada, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The role of hydrogen bonding network around the chromophore for the interaction of Rc-PYP
• R. Shiba, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity
• N. Kouduki, H. Kamikubo, T. Aizawa, Y. Ogawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Amyloid fibril inhibition mechanism of human calcitonin
• M. Sakonji, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Effect of N-terminal region to the structure formation of PYP
• M. Shimada, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus with chimeric proteins
• M. Narumi, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Roles of hydrogen bonds around chromophore in Photoactive Yellow Protein studied by OH-deficient cinnamic acid
• K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Photoreaction of PYP domain regulates the structural change during the photoreaction of phytochrome domain of Ppr
• K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, S. Yamaguchi, T. Yamada, K. Kurihara, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Protonation state of arginine 52 near the low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein

第12回日本蛋白質科学会年会, 名古屋, 2012年6月20-22日

• 芝るみ，上久保裕生，梅山美香，政さやか，山崎洋一，山口真理子，巌倉正寛，片岡幹雄
  網羅的アラニン挿入変異解析法を用いたジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現及び構造形成領域の抽出

4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations, Nara, Japan, 2012年1月9－11日

• M. Kataoka, H. Kamikubo, T. Hatsuda, M. Nakayama, N. Minamimura, S. Kayamura, C. Komeda, E. Sakai
  Molecular Anatomy of Staphylococcal Nuclease（招待講演）

The 5th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions（「揺らぎと生体機能」第5回公開シンポジウム）, Nara, Japan, 2012年1月7－8日

• T. Muto, E. Ohta, Y. Kishi, M. Yamaguchi, K. Shiraga, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
  Incorporation of Fluorescent Non-natural Amino Acids into Staphylococcal Nuclease for FRET Analyses of Induced Folding
• H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Nishiguchi, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The Roles of the Low Barrier Hydrogen Bond Involved in the Light Sensor Protein, Photoactive Yellow Protein
• M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Study on the Denatured Structure of Staphylococcal Nuclease by Using Tryptophan Triplet State Quenching
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
  Refinement of Function Element of Dihydrofolate Reductase by the Systematic Alanine Insertion
• S. Ueynagi, H. Kamikubo, Y. Ogawa, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Comparison of Structural Elements between Staphylococcal Nuclease and the C-terminal Domain of Human p100
• T. Okada, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Denatured Structure of Staphylococcal Nuclease Studied by Quenching of Tryptophan Triplet State by Cysteine
• R. Odani, Y. Yamazaki, K. Matsumoto, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The Role of N-terminal Region for Photoreaction of Various Photoactive Yellow Proteins
• E. Sakai, H. Kamikubo, A. Kogasaka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Attempt of Functional Modification of a Protein by Element Implantation
• Y. Nishiguchi, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Geometric Restriction Facilitates LBHB Formation in Photoactive Yellow Protein

2011

1st Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering, Tsukuba, Japan, 2011年11月20－24日

• H. Kamikubo, M. Kataoka
  Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds involved in Photoactive Yellow Protein（招待講演）

2011 GIST-NAIST-NCTU Joint Symposium on Advanced Materials, Gwangju, Korea, 2011年11月14－21日

• H. Kamikubo
  Phyisicochemical properties of low barrier hydrogen bonds involved in proteins（招待講演）

17th International Biophysics Congress (IUPAB), Beijing, China, 2011年10月30日－11月3日

• H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Nishiguchi, K. Yonezawa, K. Kurihara, T. Tamada, M. Kataoka
  The roles of the low barrier hydrogen bond involved in Photoactive Yellow Protein
  （Best Poster Award受賞）
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
  Refinement of function element of dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
  （Best Poster Award受賞）
• M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Local structural change of staphylococcal nuclease wild type and its non-native mutant with guanidine hydrochloride monitored by tryptophan triplet quenching
• S. Ueyanagi, H. Kamikubo, Y. Ogawa, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Comparison of structural elements between Staphylococcal nuclease and the C-terminal domain of Humanp100

特定領域研究「高次系分子科学」第12回ミニ公開シンポジウム「光受容蛋白質」, 蒲郡, 2011年10月26－27日

• 上久保裕生
  活性部位近傍に存在する水素結合と高次構造転移（招待講演）

第49回日本生物物理学会年会, 姫路, 2011年9月16－18日

• Y. Yamazaki, M. Hayashi, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Solution structure of the complex states of Rhodobacter capsulatus PYP with its binding protein
• M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Difference in local structure between staphylococcal nuclease wild type and its non-native mutant studied by tryptophan triplet quenching
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
  Classification of function element of dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
• S. Ueyanagi, H. Kamikubo, Y. Ogawa, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Comparison of structural elements between Staphylococcal nuclease and the C-terminal domain of Human p100
• T. Okada, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Denatured Structure of Staphylococcal Nuclease Studied by Triplet State Quenching of Tryptophan by Cysteine
• R. Odani, Y. Yamazaki, K. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The Role of N-terminal Region for Photoreaction of Various Photoactive Yellow Proteins
• E. Sakai, H. Kamikubo, A. Kogasaka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Attempt of functional modification of a protein by element implantation
• S. Setoguchi, H. Kubo, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Development of Light dependent protein activity control system by use of interaction of the Rc-PYP
• Y. Nishiguchi, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, T. Tamada, K. Kurihara, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Analysis of low barrier hydrogen bond in Photoactive Yellow Protein, Geometric restriction facilitates LBHB formation in PYP
• T. Muto, Y. Kishi, M. Yamaguchi, K. Shiraga, I. Iijima, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hosaka, M. Kataoka
  Structural Analysis of Intrinsically Disordered Protein Model using FRET
• S. Nagao, Y. Hattori, M. Ueda, M. Taketa, H. Osuka, H. Komori, H. Kamikubo, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi, S. Hirota
  Cytochrome c polymerization by domain swapping

合同PF研究会「PFにおけるマイクロビームを利用した XAFS, XRF, SAXS実験の展望」, つくば, 2011年9月8－9日

• 上久保裕生
  構造生物学における放射光X線溶液散乱（招待講演）

九重分光関連夏期セミナー2011, 九重, 2011年7月29日－31日

• 上久保裕生
  蛋白質中の低障壁水素結合と高次構造転移（招待講演）

KOUJIKEI 5th Symposium（特定領域研究「分子高次系機能解明のための分子科学」第5回国際公開シンポジウム）, Sapporo, Japan, 2011年7月11－13日

• H. Kamikubo
  Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds（招待講演）

2010

特定領域研究「分子高次系機能解明のための分子科学」第4回公開シンポジウム，仙台，2010年11月25−26日

• 上久保裕生
  蛋白質中に存在する低障壁水素結合の特性解析

The 4th International Symposium "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions", Otsu, Japan, 2010年11月30日－12月1日

• H. Kamikubo, S. Tadokoro, M. Kataoka
  Fluctuation controls enzymatic activity of Staphylococcal nuclease
• M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Measurements of loop formation in the denatured state of staphylococcal nuclease
• H. Sawada, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  The investigation of the relationship between non-local interaction and the effect of single alanine insertion in staphylococcal nuclease
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Iwakura, M. Kataoka
  Classification of the functional element of dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
• Y. Kishi, T. Muto, M. Yamaguchi, I. Iijima, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
  FRET analysis of structural changes in staphylococcal nuclease
• Z. Wang, Y. Hattori, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi, S. Hirota
  Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix

第48回日本生物物理学会年会，仙台，2010年9月20−22日

• H. Kamikubo, A. Kogasaka, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Synthesis of an artificial enzyme by implanting the functional elements of SNase
• Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Substitution effects of basic residues in the photoactive yellow protein of Rhodobacter caplsulatus
• M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Urea denaturation of staphylococcal nuclease monitored by tryptophan-cysteined distance
• H. Sawada, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The investigation of the relationship between non-local interaction and the effect of single alanine insertion in staphylococcal nuclease
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
  Classification of the functional element of dihydrofolate reductase (DHFR) by the systemic alanine insertion
• Y. Ogawa, H. Kamikubo, C. Komeda, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Property of a structural element of SNase-like domain in human p100
• C. Ahn, H. Kamikubo, H. Yoshioka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  The role of each residue in the flexible lambda loop of Staphylococcal nuclease on the catalytic activity
• Y. Kishi, M. Yamaguchi, I. Iijima, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, T. Hohsaka, M. Kataoka
  FRET analysis of structural changes in Staphylococcal nuclease
• M. Naruse, H. Kamikubo, S. Kametaka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, S. Waguri, S. Wakatsuki, M. Kataoka
  Solution structural analysis of Drosophila GGA
• M. Hayashi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Analysis of solution state of the interaction protein of Rc-PYP
• J. Miura, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Solution structure of the light sensor histidine kinase of Ppr comprised of the PYP and Bph domains
• S. Hirota, Y. Hattori, S. Nagao, M. Takeda, H.i Komori, H. Kamikubo, Z. Wang, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
  Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix
• D. Hamada, H. Kamikubo, Y. Hagihara, M. Kataoka
  Intrinsically less-ordered bacterial effectors: A case of EspB from enterohaemorrhagic Escherichia coli

第16回日本光生物学協会年会，吹田，2010年8月10−11日

• 山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinにおける発色団の機能変調

The 4th Shanghai International Conference on Biophysics and Molecular Biology, Shanghai-Jiashan, China, 2010年8月8−11日

• H. Sawada, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  The effect of alanine insertion mutation for folding process
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Iwakura, M. Kataoka
  Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
  (Best Poster Award受賞)

第10回日本蛋白質科学会年会，札幌，2010年6月16−18日

• 芝るみ，上久保裕生，梅山美香，政さやか，山口真理子，山崎洋一，巌倉正寛，片岡幹雄
  網羅的アラニン挿入変異解析法を用いたジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現及び構造形成領域の抽出
• 萩原義久，井上直和，浜田大三，上久保裕生，平田邦生，片岡幹雄，山本雅貴，伊川正人，岡部勝
  精子由来蛋白質IZUMO，その構造と受精膜融合での役割

特定領域研究「高次系分子科学」第5回合同班会議，南あわじ，2010年5月24−26日

• 上久保裕生
  蛋白質中に存在する低障壁水素結合の特性解析

第2回生命物質構造解析研究会，東海村，2010年3月25日

• 上久保裕生
  中性子結晶構造解析による蛋白質分子内プロトン移動機構の解明（招待講演）

分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から“何がわかるか”“何をもたらすか”」，岡崎，2010年3月23−24日

• 上久保裕生
  分子内プロトン移動：Photoactive Yellow Proteinの水素結合構造から何がわかるのか（招待講演）

2009

The 3rd International Symposium on "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions"（第3回“揺らぎと生体機能”公開シンポジウム），名古屋大学豊田講堂，名古屋，2009年12月20−21日

• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
  The properties required for the binding before folding mechanism of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease
• M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
• H. Sawada, S. M. Budamagunta, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, C. J. Voss, M. Kataoka
  Structural characterization of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease by electron paramagnetic resonance spectroscopy
• M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Local structure characterization of staphylococcal nuclease by lifetime measurement of tryptophan triplet state
• Y. Ogawa, H. Kamikubo, C. Komeda, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Extraction of the structural element of SNase-like domain in human p100 by alanine insertion analysis

日本中性子科学会第9回年会，いばらき量子ビーム研究センター，東海村，2009年12月9−10日

• 上久保裕生
  中性子結晶構造解析による蛋白質中の低障壁水素結合の発見（依頼講演）

The 1st NCTU-NAIST Workshop on "Molecular/Nano Science", National Chiao Tung University, Hsinchu, Taiwan, 2009年11月11−13日

• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein and its role in photoreaction（招待講演）
• H. Sawada, M. S. Budamagunta, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, J. C. Voss, M. Kataoka
  Structural characterization of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease by electron paramagnetic resonance spectroscopy

第47回日本生物物理学会年会，アスティとくしま，徳島，2009年10月30日−11月1日

• 山口繁生
  Low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein（若手招待講演）
• 片岡幹雄
  Detection of thermal fluctuations of protein by neutron inelastic scattering（シンポジウム招待講演）
• H. Kubo, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Light dependent enzyme activity control by use of interaction of the Rc-PYP
• Y. Yamazaki, N. Ota, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Interaction mechanism of the photoactive yellow protein of Rhodobacter caplsulatus
• Y. Hamaguchi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The low-temperature spectroscopy of Rc-PYP
• K. Matsumoto, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Analysis of the different properties in two PYPs by use of chimera proteins
• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, R. Kuroki, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein
• H. Yoshioka, S. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Crystallographic study of the alanine insertion mutants of Staphylococcal nuclease
• A. Kogasaka, H. Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Attempt to create an artificial functional protein by exchange of functional elements
• K. Saito, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  Direct structural modulation of the structure element of SNase by using the azobenzene linkage
• M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  F-value analysis of induced folding: The role of the ligand binding in induced folding of disordered staphylococcal nuclease mutant
• H. Sawada, S. M. Budamagunta, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, C. J. Voss, M. Kataoka
  Structural characterization of the intrinsically disordered mutants of staphylococcal nuclease by electron paramagnetic resonance spectroscopy
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Iwakura, M. Kataoka
  Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
• Y. Ogawa, H. Kamikubo, C. Komeda, M. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Extraction of the structural element of SNase-like domain in human p100 by alanine insertion analysis

第36回生体分子科学討論会，北海道大学，札幌，2009年6月19−20日

• 片岡幹雄、上久保裕生、山口繁生
  イェロープロテインの低障壁水素結合の形成とその役割

The 6th Asian Biophysics Association (ABA) Symposium, 香港科学技術大学、Hong Kong, 2009年1月11−15日

• H. Kamikubo, S. Yamaguchi, K. Kurihara, R. Kuroki, N. Niimura, N. Shimizu, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Neutron and X-ray crystallographic study of photoactive yellow protein
• H. Nakanishi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Interaction between BLUF domain and the C-terminal region of AppA
• N. Ota, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  N-terminal deletion effect in the Rc-PYP
• S. Tadokoro, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Influence of loope modification in staphylococcal nuclease on its structure and activity

2008

第46回日本生物物理学会年会，福岡国際会議場，福岡，2008年12月3−5日

• S. Tadokoro, H. Kamikubo, S. Yamaguchi, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  The role of theflexible loop in staphylococcal nuclease on its catalyticactivity
• R. Nakagaki, H.Kamikubo, Y. Yamazako, M. Kataoka
  Role of leucine 108 for the folding of staphylococcal nuclease
• H. Sawada, H.Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazako, M. Kataoka
  The effect of alanine insertion mutation for folding kinetics
• Y. Yamazaki, H.Kamikubo, M. Kataoka
  Spectral characterization of the complex form of the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsolatus
• H. Kamikubo, T. Koyama, M. Hayashi, K. Shirai, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  The phtotreaction of the PYP domain in the light sensor histidine kinase Ppr is influenced by the C-terminal domain
• N. Ota, Y. Yamazako, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Role of the N-terminal cap in the Rc-PYP
• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, R. Kuroki, N. Niimura, N. Shimizu, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Direct observation of two distinct types of short hydrogen bond in photoactive yellow protein
• C. Komeda, Y. Yamazako, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Foldability of SNase-like domain in human p100
• R. Shiba, H. Kamikubo, M. Umeyama, S. Tsukasa, Y. Yamazaki, M. Iwakura, M. Kataoka
  Extraction of the regions encoded foldability and/or functionability from dihydrofolate reductase by the systematic alanine insertion
• Y. Yamada, H. Tsuihiji, K. Shirai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Identification of the structural and functional element of photoactive yellow protein
• H. Nakanishi, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Intramolecolar interaction for light-responsible regolation in AppA

Symposium on Neutron Protein Crystallography (NPC) -Current Status and Future Prospect-, JAEA Ricotti, Tokai, Japan, 2008年8月21−22日

• H. Kamikubo
  Direct observation of two distinct types of short hydrogen bond in Photoactive Yellow Protein（招待講演）

2007

　　

第45回生物物理学会年会，パシフィコ横浜，横浜，2007年12月21−23日

• 上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
  研究室系X線溶液散乱回折装置の立ち上げ
• 鬼塚正義，上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
  C末端欠損スタフィロコッカルヌクレアーゼが示す誘導折り畳み反応の分子メカニズム
• 澤田宏起，上久保裕生，鬼塚正義，山崎洋一，片岡幹雄
  アラニン挿入変異が折れ畳み過程に及ぼす影響
• 政さやか，上久保裕生，梅山美香，山崎洋一，巌倉正寛，片岡幹雄
  ジヒドロ葉酸還元酵素におけるフォールディングエレメントや活性部位の接続部位に含まれる情報の抽出
• 芝るみ，上久保裕生，梅山美香，山崎洋一，巌倉正寛，片岡幹雄
  網羅的アラニン挿入変異法によるジヒドロ葉酸還元酵素の構造形成および機能発現領域の抽出
• 浴口真幸，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
  Rhodobacter capsolatus由来PYPの光反応におけるpH依存性
• 小山知則，上久保裕生，山崎洋一，片岡幹雄
  紅色光合成細菌Rhosospirillum centenum由来PYP様ドメインの光反応サイクルの特性
• 永田大介，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Ala/ValスキャニングによるPhotoactive Yellow Proteinの構造・機能に対する重要なアミノ酸残基のマッピング
• 山口繁生，上久保裕生，栗原和男，山崎洋一，大西裕季，黒木良太，新村信雄，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinを用いた中性子結晶構造解析
• 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Rhodobacter capsolatus PYPの分光学的特性の解析
　　

The 2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology，東京，2007年9月10−13日

• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Ohnishi, R. Kuroki, N. Niimura, M. Kataoka
  Determination of hydrogen positions of photoactive yellow protein

The 9th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation, Manchester Bridgewater Hall, Manchester, UK, 2007年8月12−17日

• H. Kamikubo, K. Hirako, H. Sawada, M. Kawasaki, R. Kato, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
  Solution structural analysis of GGA(VHS-GAT) and the complexes with its binding partners using solution X-ray scattering
• H. Kamikubo, H. Sawada, M. Kataoka
  Wide angle X-ray solution scattering reveals the structure of photointermediate of photoactive yellow protein
• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Kurihara, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Ohnishi, R. Kuroki, N. Niimura, M. Kataoka
  Determination of hydrogen positions of photoactive yellow protein

14回日本光生物学協会年会，奈良先端科学技術大学院大学ミレニアムホール，生駒，2007年7月30−31日

• 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  光合成細菌Rhodobacter capsolatus 由来PYPの分光学的特性

日本物理学会2007年春季大会，鹿児島大学，鹿児島，2007年3月18−21日

• 山口繁生，上久保裕生，清水伸隆，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinを用いた中性子回折実験及び高分解能X線結晶構造解析

2006

The 4th Open Workshop "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecoles" （第4回“水と生体分子”公開ワークショップ），京都テルサ，京都，2006年12月18−19日

• D. Kitamura, Y. Yamazaki, K. Shirai, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  The effect of simplified amino acid sequence on conformational stability and catalysis of staphylococcal nuclease
• H. Tsuihiji, H. Kamikubo, K. Shirai, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Investigation of the structural and functional regions of photoactive yellow protein by using systematic alanine insertion
• M. Umeyama, H. Kamikubo, M. Iwakura, M. Kataoka
  Extraction of the essential regions of dihydrofolate reductase sequence by alanine insertion perturbation analysis
• S. Kato, H. Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Elucidation of the unfolding-state and the folding process of the disolfide-bond introduced mutant of staphylococcal nuclease
• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Preparation of large crystal of photoactive yellow protein for neutron diffraction and high resolution crystal structure analysis
• K. Hirako, H. Kamikubo, M. Kawasaki, R. Kato, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
  Structural analysis of GGA(VHS-GAT)?Arf complex using SAXS measurement

The 3rd Asia and Oceania Conference on Photobiology, Beijing, China, 2006年11月17−20日

• H. Kamikubo
  Structural characterization of the active state of Photoactive yellow protein using the wide-angle x-ray scattering（招待講演）

第44回生物物理学会年会，沖縄コンベンションセンター，那覇，2006年11月12−16日

• H. Kamikubo, M. Kataoka
  Structural characterization of an active state using the wide-angle solution X-ray scattering（シンポジウム招待講演）
• M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Characterization of conformational rearrangement during the folding process of Staphylococcal nuclease
• M. Umeyama, H. Kamikubo, M. Iwakura, M. Kataoka
  Extraction of the essential regions of dihydrofolate reductase sequence by alanine insertion perturbation analysis
• K. Shirai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Attempt to understand the information encoded in the amino acid sequence of photoactive yellow protein by the simplification of sequence
• H. Tsuihijji, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  The relationship between conformation and activity of NifA
• K. Hirako, H. Kamikubo, M. Kawasaki, R. Kato, K. Nakayama, S. Wakatsuki, M. Kataoka
  Structural analysis of GGA(VHS-GAT)-Arf complex using SAXS measurement
• S. Kato, H. Kamikubo, M. Onitsuka, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Elucidation of the unfolding-state and the folding process of the disolfide-bond introduced mutant of staphylococcal nuclease
• Y. Ikeda, J. Gohara, Y. Imamoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, T. Kawakami, S. Yoshimura, S. Aimoto, M. Kataoka
  Interaction of arrestin with phosphorylated rhodopsin C-terminus peptide
• S. Ano, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Elucidation of interaction domains for AppA-PpsR complex
• S. Yamaguchi, H. Kamikubo, N. Shimizu, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Neutron diffraction and high resolution X-ray crystal structure analysis of photoactive yellow protein
• Y. Imamoto, H. Sasayama, M. Harigai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Conformational change of b5-b6 loop during the photocycle of photoactive yellow protein
• Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Isolation of photoactive yellow protein associated protein from Rhodobacter capsolatus

2005

2005年第43回生物物理学会年会，札幌コンベンションセンター，札幌，2005年11月23−25日

• 馬場隆，上久保裕生，鬼塚正義，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal nucleaseの折り畳み反応におけるグリセロール添加の効果
• 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  紅色光合成細菌Rhodobacter capsolatus由来PYPの光反応の解析と生理条件下における反応の考察
• 笹山裕晃，針貝美樹，上久保裕生，山崎洋一，今元　泰，片岡幹雄
  イエロープロテインにおける発色団ループの役割
• 上久保裕生，川崎政人，加藤龍一，中山和久，若槻壮市，片岡幹雄
  アダプター蛋白質GGAの自己阻害機構の構造学的検証
• 坂本亜沙美，山崎洋一，白井久美子，上久保裕生，今元　泰，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinにおけるアミロイド線維形成
• 鬼塚正義，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  スタフィロコッカルヌクレアーゼの折り畳み過程におけるサブドメイン間相互作用形成の検証
• 加藤真悟，上久保裕生，鬼塚正義，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  スタフィロコッカルヌクレアーゼの折り畳み過程における長距離相互作用の役割
• 徳久淳師，城地保昌，上久保裕生，中川洋，北尾彰朗，片岡幹雄
  非干渉性弾性中性子散乱実験に見られる非ガウス性からの蛋白質ダイナミクス情報抽出の試み
• 中田浩司，白井久美子，今元泰，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
  単純化されたアミノ酸配列を持つPYPの機能回復
• 山口繁生，上久保裕生，清水伸隆，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  中性子結晶構造解析に用いるPYP結晶の調整

第12回日本光生物学協会年会，京都大学・京都テルサ，京都，2005年8月5−7日

• 中田浩司，白井久美子，今元泰，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
  単純化されたアミノ酸配列を持つPYPの機能回復

The 2nd Open Workshop "Chemistry of Biological Proesses Created by Water and Biomolecoles", Kokuyo Hall, Tokyo, Japan, 2005年3月17-18日

• A. Tokuhisa, Y. Joti, H. Kamikubo, H. Nakagawa, A. Kitao, M. Kataoka
  Correlation between Protein Dynamics and the Elastic Incoherent Neutron Scattering Profile Studied by Molecolar Dynamics Simolation
• K. Shirai, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  An Attempt to Understand the Information Encoded in the Amino Acid Sequence of Photoactive Yellow Protein by the Simplification of Sequence
• M. Onitsuka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  The Mechanism of Substrate-Induced Folding of Staphylococcal Nuclease
• A. Sakamoto, Y. Yamazaki, K. Shirai, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Photoactive Yellow Protein can Form Amyloid Fibrils

2004

第42回生物物理学会年会，国立京都国際会館，京都，2004年12月13−15日

• 上久保裕生，村崎康浩，川崎政人，加藤龍一，中山和久，若槻壮市，片岡幹雄
  Ｘ線溶液散乱測定によるアダプター蛋白質GGA（VHS-GAT）の溶液構造の解析
• 村崎康浩，上久保裕生，川崎政人，加藤龍一，中山和久，若槻壮市，片岡幹雄
  GGA蛋白質2量体形成のおけるVHSドメインの関与
• 守田真，福角勇人，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  青色光受容タンパク質AppAのPpsRとの相互作用に関わる分光学的特性
• 笹山裕晃，針貝美樹，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  イエロープロテインにおけるβ5-β6ループの役割
• 針貝美樹，今元泰，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
  Photoactive yellow proteinにおけるMet100ループの役割
• 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  紅色光合成細菌Rhodobacter capsolatus由来PYPの相互作用分子の探索
• 福角勇人，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  PpsRの会合状態とDNA結合能に関するPASドメインの役割
• 對比地久義，山崎洋一，上久保裕生，片岡幹雄
  紅色光合成細菌Ectothiorhodospira halophila由来NifAのオリゴマー形成に関する研究
• 藤本知志，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  光応答性融合蛋白質の設計と創成
• 鬼塚正義，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  スタフィロコッカルヌクレアーゼの非天然構造における基質認識機構
• 白井久美子，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive yellow proteinにおける配列情報の理解の試み
• 徳久淳師，城地保昌，上久保裕生，中川洋，北尾彰朗，片岡幹雄
  分子動力学計算を用いた活性部位の動的性質の解明

8th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation, Egret Himeji, Himeji, Japan, 2004年9月7−11日

• H. Kamikubo, N. Shimizu, M. Harigai, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Structural characterization of the M intermediate of Photoactive yellow protein using solution x-ray scattering

11th International Conference on Retinal Proteins, Frauenchiemsee, Germany, 2004年6月20−24日

• M. Harigai, Y. Imamoto, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Role of amino acid residues in Met100 loop of photoactive yellow protein
• Y. Imamoto, M. Harigai, H. Kamikubo, Y.Yamazaki, M.Kataoka
  Secondary structural change of photoactive yellow protein

The 1st Pacific-Rim International Conference on Protein Science, The 4th Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan, Pacifico Yokohama, Yokohama, Japan, 2004年4月14−18日

• H. Tsuihiji, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  The isolation and characterization of transcriptional activator NifA from photosynthetic bacteria, Ectothiorhodospira halophila
• M. Onitsuka, H. kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Substrate-induced folding of Staphylococcal nuclease

2003

日本蛋白質科学会第3回年会，札幌コンベンションセンター，札幌，2003年6月23−25日

• 白井久美子，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  単純化されたアミノ酸配列を持つイエロープロテインの物性
• 片岡幹雄，中川洋，初田竜也，山崎洋一，上久保裕生
  Staphylococcal nuclease のヘリックス領域への系統的アラニン挿入の影響

日本物理学会第58回年次大会，東北大学川内キャンパス・東北学院大学土樋キャンパス，仙台，2003年 3月28−31日

• 上久保裕生，清水伸隆，針貝美樹，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  X線溶液散乱測定法を用いたPhotoactive Yellow Proteinの光による構造変化の解析
• 清水伸隆，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
  イエロープロテインのL中間体で生じる水分子の変化
• 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
  非干渉性中性子弾性散乱による蛋白質動力学の研究

2002

第40回生物物理学会年会，名古屋大学東山キャンパス，名古屋，2002年11月2−4日

• 今元泰，針貝美樹，上久保裕生，清水伸隆，片岡幹雄
  イエロープロテインの光による構造変化－I
• 上久保裕生，清水伸隆，針貝美樹，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  イエロープロテインの光による構造変化－II
• 山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  C末端His-tag PYPを用いたPYPの相互作用の解析
• 清水伸隆，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
  イエロープロテインの光反応中での発色団のpKa制御メカニズム
• 平野聡，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal nucleaseの構造形成に果たす140Trpの役割
• 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
  非干渉性中性子弾性散乱による蛋白質の動力学転移の研究
• 平岡聡，上久保裕生，中川洋，平野聡，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal NucleaseのΩループ改変による機能及び構造安定性の評価
• 白井久美子，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive yellow proteinのアミノ酸配列の単純化の試み
• 龍見さなえ，清水伸隆，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinにおける グリシンの役割
• 久保田進、上久保裕生、山崎洋一、今元泰、片岡幹雄
  非天然構造Staphylococcal nucleaseの疎水性相互作用増加による構造形成及び構造安定化
• 安田玲里、清水伸隆、山崎洋一、上久保裕生、今元泰、片岡幹雄
  アラニン置換を利用したPhotoactive Yellow Proteinの構造形成及び機能発現機構の研究

10th International Conference on Retinal Proteins, University of Washington, Seattle, USA, 2002年8月20−24日

• M. Kataoka, H. Kamikubo
  Structure and Properties of Photointermediate and Relationship to the Photoreaction（招待講演）
• Y. Imamoto, H. Kamikubo, M. Harigai, N. Shimizu, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Direct Observation of Light-Induced Global Conformational Change of Photoactive Yellow Protein
• Y. Imamoto, C. Tamura, H. Kamikubo, M. Kataoka
  Self-Association of Bovine Visual Arrestin as Revealed by Small Angle X-Ray Scattering
• N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Imamoto, Y. Yamazaki, K. Mihara, M. Kataoka
  Crystal Structure of R52Q Mutant of Photoactive Yellow Protein

224th American Chemical Society National Meeting, Boston, USA, 2002年8月18−22日

• H. Nakagawa, H. Kamikubo, J. C. Smith, M. Kataoka
  Difference of dynamics between folded and unfolded protein studied by elastic incoherent neutron scattering

First International Conference on Biomedical Spectroscopy, Cardiff, Wales, UK, 2002年7月7−10日

• E. Mano, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  Comparison of the photochemical reaction of PYP in crystal and aqueous solution

1st Asian Conference on Photobiology, Awaji Yumebutai International Conference Center, Hyogo, Japan, 2002年6月26−28日

• Y. Imamoto, M. Harigai, N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  Structure and Photoreaction of Photoactive Yellow Protein （招待講演）
• H. Kamikubo, M. Kataoka
  Relationship between crystal structure and low-resolution structure of photointermediates（招待講演）
• N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Imamoto, Y. Yamazaki, K. Mihara, M. Kataoka
  Crystal Structures of E46Q and R52Q Mutants of Photoactive Yellow Protein

第2回日本蛋白質科学会年会，名古屋国際会議場，名古屋，2002年 6月13−15日

• 平野聡，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal nucleaseの140Trp近傍相互作用のシステイン架橋による置き換え
• 白井久美子，山崎洋一，上久保祐生，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive yellow protein (PYP) のアミノ酸配列の単純化の試み

2001

4th International Conference on Biological Physics 2001，京都国際会館，京都，2001年月7日30日−8月3日

• N. Shimizu, H. Kamikubo, Y. Imamoto, K. Mihara, M. Kataoka
  Elucidation of molecolar recognition mechanism of photoactive yellow protein using ionic molecoles
• S. Hirano, K. Mihara, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, Y. Imamoto, M. Kataoka
  The structural role of C-terminal region of Staphylococcal nuclease
• H. Nakagawa, H. Kamikubo, I. Tukushi, T. Kanaya, M. Kataoka
  The origin of non-gaussianity in q dependence of incoherent elastic neutron scattering

第39回生物物理学会年会，大阪大学，吹田，2001年10月6−8日

• 上久保裕生，清水伸隆，山本泰輝，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive yellow proteinのM中間体崩壊過程の律速段階
• 山崎　洋一，上久保　裕生，今元泰，片岡　幹雄
  Photoactive yellow proteinの相互作用分子の探索
• 平野聡，山崎洋一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  システイン架橋導入によるStaphylococcal nucleaseの構造安定化の試み
• 中川洋，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal nucleaseの非天然状態にみられる基質認識や折り畳みの本質的情報
• 針貝美樹，清水伸隆，安田早苗，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  N末端欠損PYPの構造と光反応

第1回日本蛋白質科学会年会，大阪大学，吹田，2001年6月1−3日

• 今元泰，田村千恵，上久保裕生，片岡幹雄
  ウシアレスチンの多量体形成の解析
• 清水伸隆，上久保裕生，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
  モデル低分子を用いたPhotoactive yellow proteinの分子認識機構の解明
• 平野聡，上久保裕生，山崎洋一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal Nucleaseの構造保持におけるC末端の役割
• 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
  中性子非干渉性弾性散乱のq依存性における非ガウス性の起源

日本物理学会　第56回年次大会，中央大学多摩キャンパス，東京，2001年3月27−30日

• 清水伸隆，上久保裕生，今元泰，三原憲一，片岡幹雄
  中間体の構造安定によるPhotoactive yellow proteinの光反応の変化
• 平野聡，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal Nucleaseの構造保持におけるC末端の役割
• 中川洋，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
  挿入変異体を用いたStaphylococcal nucleaseの非天然状態の研究
• 安田早苗，三原憲一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinの機能に対する C末端部位の役割
• 針貝美樹，安田早苗，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  N末端欠損PYPの構造と光反応

2000

9th International Conference on Retinal Proteins, Szeged, Hungary, 2000年9月14-19日

• S. Yasuda, K. Mihira, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka
  The Role of C-terminal Residues on the Function of Photoactive Yellow Protein

第38回生物物理学会年会，東北大学川内キャンパス，仙台，2000年9月11−13日

• 清水伸隆，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
  PYPのM中間体の静電的性質に対するArg52の寄与
• 平野聡，三原憲一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  C末端欠損がStaphylococcal Nucleaseの構造に与える効果
• 田村千恵，今元泰，上久保裕生，片岡幹雄
  Ｘ線溶液散乱法によるアレスチン会合状態の解析
• 中川洋，上久保裕生，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
  中性子非干渉性弾性散乱によるStaphylococcal nucleaseのガラス転移の研究
• 安田早苗，原憲一，上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  Photoactive Yellow Proteinの機能へのC末端部位の役割

日本物理学会　2000年春の分科会，関西大学，吹田，2000年3月22−25日

• 清水伸隆，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
  PYPのM中間体で生じる静電的性質の変化
• 平野聡，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
  Staphylococcal NucleaseのC末欠損が構造に与える効果
• 田村千恵，今元泰，上久保裕生，片岡幹雄
  X線溶液散乱法によるアレスチン会合状態の解析
• 中川洋，上久保裕生，平野聡，筑紫格，金谷利治，片岡幹雄
  非干渉性中性子弾性散乱によるStaphylococcal Nucleaseの水和依存的なダイナミックスと動的不均一性

1999

第37回生物物理学会年会，和光市市民文化センター，和光，1999年10月2-5日

• 上久保裕生，今元泰，片岡幹雄
  バクテリオロドプシンのDark-Nに見られる高次構造変化
• 大石真市，上久保裕生，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
  PYPの安定性と光の効果
• 清水伸隆，上久保裕生，濱田格雄，三原憲一，今元泰，片岡幹雄
  暗状態PYP及びPYPMの溶質分子との静電相互作用
• 平野聡，三原憲一，上久保裕生，片岡幹雄
  C末欠損がStaphylococcal Nucleaseの構造に与える効果